40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0407 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0407  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0037084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3934  protein of unknown function DUF541  42.62 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0417  protein of unknown function DUF541  45.64 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3582  hypothetical protein  39.57 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0237559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  26 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  23.95 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  24.07 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  22.64 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  23.61 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  24.28 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  25.12 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  22.32 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  21.43 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  22.64 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  22.64 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  22.64 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  23.56 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  26.58 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  24.34 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  23.88 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  23.88 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  24.88 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  22.46 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  23.38 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0373  hypothetical protein  23.95 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  23.41 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  25.94 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  24.22 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  21.89 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  23.08 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  23.29 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  22.38 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  21.81 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  22.65 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  22.03 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  21.93 
 
 		 237 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  25.64 
 
 		 242 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>