23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3934 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3934  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 243 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0417  protein of unknown function DUF541  45.28 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0407  protein of unknown function DUF541  42.62 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0037084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3582  hypothetical protein  41.42 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0237559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  27.05 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  24.59 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  24.38 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  23.97 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  23.97 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  23.97 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  23.97 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  25.35 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  25.45 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  23.77 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  26.15 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  23.01 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  25.31 
 
 		 231 aa  52.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  21.33 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  22.04 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  25.71 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>