129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2769 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  100 
 
 
247 aa  486  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  40.93 
 
 
241 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  40.93 
 
 
241 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  40.93 
 
 
241 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  40.64 
 
 
240 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  41.35 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  38.91 
 
 
244 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  39.68 
 
 
237 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  37.8 
 
 
210 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  30.45 
 
 
254 aa  89  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  32.43 
 
 
246 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  30.33 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  31.46 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  31.19 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  27.32 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  31.19 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1487  hypothetical protein  31.1 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380909  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  30.86 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  30.37 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  30.53 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  31.19 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1489  protein of unknown function DUF541  35.41 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  30.77 
 
 
281 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  31.58 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  31.58 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  29.43 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5359  protein of unknown function DUF541  32.86 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  27.76 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  30.35 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  32.26 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  30.93 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  26.8 
 
 
251 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  26.92 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  27.97 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  28.05 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  25.52 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  26.94 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  29.36 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0882  protein of unknown function DUF541  29.17 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  30.23 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  27.98 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  31.6 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4810  hypothetical protein  31.02 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338459  hitchhiker  0.000318481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  30.58 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  27.4 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  31.13 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  26.94 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  30.1 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  27.08 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  26.34 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  27.23 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30160  hypothetical protein  31.8 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1584  putative lipoprotein  23.57 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000181169  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  28.04 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  28.12 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  27.33 
 
 
227 aa  58.9  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  25.85 
 
 
242 aa  58.9  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  26.54 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  26.92 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  26.32 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  25.45 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  23.53 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  26.32 
 
 
242 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  29.44 
 
 
248 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  25.42 
 
 
242 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  27.49 
 
 
241 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  25.95 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  31.95 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2333  hypothetical protein  26.28 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0753305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  26.06 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  30.17 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  30.16 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  30.16 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  30.16 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  30.16 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  30.16 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  30.16 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  30.16 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  30.16 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  30.16 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3089  hypothetical protein  26.22 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  27.4 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  27.39 
 
 
245 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  30.16 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  28.04 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  25.7 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  27.01 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  27.91 
 
 
250 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  28.04 
 
 
230 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1109  hypothetical protein  25.59 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  29.49 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  29.59 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  29.59 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  29.59 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  29.59 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  26.35 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2298  protein of unknown function DUF541  26.21 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.568892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  27.65 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  26.35 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>