116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5359 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5359  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 238 aa  463  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  32.86 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  30.59 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  30.59 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  30.59 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  33.18 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  31.66 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  30 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  29.81 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  32.86 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  34.1 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  30 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  29.95 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  28.1 
 
 		 240 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  29.13 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  28.09 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  27.62 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  27.1 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  29.9 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  30.62 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  28.96 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  25.23 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  28.77 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  35.32 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1489  protein of unknown function DUF541  34.96 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  29.9 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1487  hypothetical protein  35.24 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  29.89 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  23.15 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  27.32 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  27.32 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  27.32 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.85 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  31.4 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  27.85 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  29.49 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  28.57 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  33.49 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  30.81 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  28.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  28.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  28.19 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  28.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  28.85 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  28.85 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  28.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  28.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  28.85 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  28.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  28.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  25.76 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  28.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  28.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  32.42 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  25.97 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  26.04 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  26.79 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  25.81 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  30 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  27.96 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  26.79 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  26.79 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  26.79 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  26.79 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  26.83 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  28.21 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  29.12 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  28.26 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  26.86 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  28.26 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  26.53 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  26.63 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  30.43 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  27.72 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  26.29 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  26.09 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  26.21 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  26.2 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30160  hypothetical protein  34.12 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  27.72 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  25.93 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  25.24 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  28.36 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  32.2 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  32.52 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  29.01 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  31.87 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  32.2 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  21.46 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  28.49 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  31.25 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  31.79 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  28.18 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  25.73 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0141  protein of unknown function DUF541  25.87 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  22.99 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  25.73 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  27.59 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>