152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1487 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1487  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  406  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380909  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1489  protein of unknown function DUF541  59.8 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  34.47 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  34.47 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  34.47 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  32.43 
 
 
251 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  32.85 
 
 
245 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  34.78 
 
 
237 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  31.82 
 
 
250 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  31.82 
 
 
234 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  37.8 
 
 
210 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  34.13 
 
 
244 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  35.85 
 
 
246 aa  95.9  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  34.45 
 
 
254 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  37.91 
 
 
243 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  37.04 
 
 
254 aa  91.3  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  31.1 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  38.27 
 
 
254 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  30.48 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  33.17 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  30.99 
 
 
242 aa  88.2  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  30.95 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30160  hypothetical protein  36.89 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  34.58 
 
 
265 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  30.1 
 
 
244 aa  85.9  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  30.33 
 
 
243 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  28.71 
 
 
251 aa  82  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  29.52 
 
 
246 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  27.75 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  29.47 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  27.75 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  27.75 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  29.19 
 
 
251 aa  79  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  29.29 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  27.27 
 
 
259 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  33.54 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0882  protein of unknown function DUF541  40.59 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307709 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  30.14 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  30.14 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  30.14 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  29.72 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  30.66 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  30.14 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  30.14 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  28.78 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  32.38 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  32.52 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  30.24 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  28.5 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  32.08 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  32.08 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  29.67 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  32.52 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  29.19 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  29.19 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  29.19 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  29.19 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  29.19 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  29.19 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  29.19 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  29.19 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  29.19 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  25.37 
 
 
238 aa  72  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  24.39 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  27.62 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  26.07 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5359  protein of unknown function DUF541  35.24 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  23.9 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  30.73 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  29.15 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  25.48 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  28.71 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  30.81 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  26.17 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  33.94 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  25.24 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  25.71 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  29.47 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  35.71 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  30.81 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  27.45 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  32.38 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  25.84 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  25.84 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  25.84 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  28.11 
 
 
251 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  24.52 
 
 
237 aa  62  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  28.64 
 
 
241 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  29.58 
 
 
248 aa  61.6  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  31.9 
 
 
242 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  24.52 
 
 
237 aa  61.6  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  33.94 
 
 
240 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  24.52 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  31.31 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  27.44 
 
 
243 aa  60.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  24.52 
 
 
237 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  24.52 
 
 
237 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  24.52 
 
 
237 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  27.15 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>