55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30160 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30160  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  398  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  34.13 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0882  protein of unknown function DUF541  44.12 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  33 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  33 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  33 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  38.83 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  35.47 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  28.44 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1487  hypothetical protein  37.2 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380909  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  30 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  30.43 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  36.65 
 
 		 265 aa  72  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  29.56 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  31.25 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  28.43 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  28.57 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  32.23 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1489  protein of unknown function DUF541  37.62 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  31.43 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  27.88 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  31.88 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  25.24 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  27.01 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  26.01 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  28.08 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  24.86 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  26.61 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  33.49 
 
 		 256 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  27.49 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  25 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  26.24 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  28.97 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  27.1 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  29.11 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  26.42 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  30.18 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  23.96 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  31.71 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  25 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  27.01 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  31.48 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  30.46 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  26.34 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  26.29 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  31.02 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  23.85 
 
 		 259 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5359  protein of unknown function DUF541  32.42 
 
 		 238 aa  42  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  21.76 
 
 		 229 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  27.78 
 
 		 240 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  25.93 
 
 		 243 aa  41.2  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>