77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2904 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2904  protein of unknown function DUF541  100 
 
 
268 aa  512  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.369203  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0620  protein of unknown function DUF541  38.13 
 
 
246 aa  122  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.276272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  37.16 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2298  protein of unknown function DUF541  34.47 
 
 
251 aa  92.8  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.568892 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  31.8 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  29.83 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  29.32 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  29.28 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  29.32 
 
 
223 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  29.28 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  29.32 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  28.73 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  29.32 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  28.8 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  31.18 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  30.91 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  29.09 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  30.8 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  28.11 
 
 
243 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  32.78 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  29.82 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2733  protein of unknown function DUF541  30.29 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.112728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  27.97 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  26.25 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  29.61 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  26.61 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  30.23 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  27.22 
 
 
230 aa  59.3  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  27.04 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  30.84 
 
 
242 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  25.14 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4106  hypothetical protein  30.51 
 
 
157 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.62913e-48 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  26.71 
 
 
220 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  27.67 
 
 
231 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  26.67 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  26.01 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  23.61 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  27.31 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  26.54 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  26.54 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  26.54 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  26.58 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  27.57 
 
 
238 aa  52.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  26.34 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  25.22 
 
 
242 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  25 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  25.29 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0882  protein of unknown function DUF541  30.62 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  28.5 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  26.43 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  33.08 
 
 
234 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  24.78 
 
 
242 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  23.77 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  25.73 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  26.73 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  25.99 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  25.89 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  28.1 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  27.27 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  24.3 
 
 
251 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  27.33 
 
 
245 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  29.24 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  25.55 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  23.29 
 
 
245 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  27.78 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  27.14 
 
 
232 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  27.17 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  30.25 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  29.11 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  26.79 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1791  hypothetical protein  30.2 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  28.66 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  28.25 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  29.63 
 
 
241 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  28.75 
 
 
246 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  28.75 
 
 
246 aa  42.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  26.04 
 
 
235 aa  42.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>