134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00770 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00770  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  497  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  28.69 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  27.48 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  30.8 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  33.02 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  33.02 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  30.87 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  33.02 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  29.67 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  30.04 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  27.11 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  29.53 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  30.92 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  27.18 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  30.26 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  29.38 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  27.35 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  30.81 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  26.67 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  29.92 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  29.48 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  31.78 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  27.01 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  30.05 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  27.52 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  29.38 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  29.85 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  31.28 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  30.99 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  31.28 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  28.38 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  29.38 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  30.32 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  27.52 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  30.52 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  30.2 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  28.9 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  29.25 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  31.18 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  27.06 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  27.06 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  31.79 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  24.42 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  27.52 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  29.65 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  25.69 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  27.35 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  26.61 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  26.61 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  30.19 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  27.06 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  31.25 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  30.54 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  27.23 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  30.56 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  29.3 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  25.55 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  30.54 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  29.15 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  22.98 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  26.16 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  25.89 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  24.76 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  30.77 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  29.86 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  28.17 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  26.29 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  30.41 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  26.17 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  30.3 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  27.33 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  27.62 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  28.9 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  28.11 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  26.25 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  25.36 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  28.1 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  28.1 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  28.1 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  25.82 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4429  protein of unknown function DUF541  29.3 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  25.91 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  26.94 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2473  protein of unknown function DUF541  31.89 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.065986  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4493  protein of unknown function DUF541  29.3 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  24.52 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2298  protein of unknown function DUF541  31.08 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.568892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  24.12 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  24.88 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4106  hypothetical protein  26.09 
 
 		 157 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.62913e-48 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  26.13 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  23.61 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  25.82 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  28.9 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  26.03 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2333  hypothetical protein  25.75 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0753305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  23.04 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>