136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2473 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2473  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 242 aa  487  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.065986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  70.89 
 
 		 242 aa  294  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  62.29 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1791  hypothetical protein  52.79 
 
 		 237 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  45.24 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  31.46 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  34.38 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  34.29 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  33.72 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  32.54 
 
 		 237 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  29.36 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  30.45 
 
 		 251 aa  85.5  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  28.75 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  28.75 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  31.43 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  28.86 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  27.54 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  34.34 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  28.21 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  28.71 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  31.37 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  26.49 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  34.34 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  29.95 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  32.35 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  32.61 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  32.5 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  32.35 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  33.73 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  29.68 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  27.16 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  29.06 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  26.09 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  29.03 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  28.02 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  31.11 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  29.03 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  29.03 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  29.03 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  26.79 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  29.03 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  34.5 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  34.38 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  29.03 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  24.66 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  25.64 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  34.65 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  31.87 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  30.56 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  25.86 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  28.39 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  26.69 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  29.47 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  25.86 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  31.9 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  27.32 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  34.5 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  28.51 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  31.79 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  27.9 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  26.67 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  25.74 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  27.66 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  24.57 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  27.66 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  27.66 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  27.66 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  27.66 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  26.6 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  26.6 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  26.6 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  23.53 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  26.6 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  26.6 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  26.6 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  26.6 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  26.6 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  26.6 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  31.37 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  32.07 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  32.07 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  26.45 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  32.58 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  31.41 
 
 		 247 aa  62  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2333  hypothetical protein  24.89 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0753305 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  24.86 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  26.77 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  24 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  26.51 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  31.84 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  23.45 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  26.12 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  28.14 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  28.14 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  28.14 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  27.68 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  28.14 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  27.32 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  27.68 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  27.68 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>