160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0606 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  100 
 
 		 143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  48.53 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  59.26 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  43.18 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  41.96 
 
 		 239 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  42.54 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  40 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  40.16 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.88 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  33.81 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  37.7 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1441  DoxX family protein  42.99 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0421253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  40 
 
 		 204 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  44.21 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  36.36 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  50.57 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  35.29 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  38.53 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  44.19 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  37.88 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  38.1 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  35.96 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  36.54 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  36.73 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  37.11 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  34.38 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  35.71 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35.2 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  30.15 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  30.71 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  32.61 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.53 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  32.56 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  43.02 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  42.53 
 
 		 199 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  43.53 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  43.02 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  36.63 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  35.58 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  39.78 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  30.33 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  37.11 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  38.24 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  42.17 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  35.82 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  39.78 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  32.71 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  37.93 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  34.55 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  33.64 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  33.96 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  36.75 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  37.93 
 
 		 152 aa  50.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  34.21 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  42.19 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  33.33 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  33.33 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  33.64 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  35.05 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  35.05 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  35.05 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  33.79 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  35.05 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7103  membrane protein-like protein  34.92 
 
 		 274 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0284087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  39.77 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  31.78 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  33.02 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  33.63 
 
 		 232 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  31.52 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  34.48 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  28.57 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  33.33 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  37.5 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  29.27 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  30.08 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  34.02 
 
 		 197 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  27.96 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  30.1 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  43.1 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  31.73 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  43.1 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  43.1 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  37.76 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  37.76 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  37.76 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  37.76 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  37.76 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  37.76 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  31.62 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  37.76 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  30.43 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  29.2 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  33.67 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  34.88 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  30.17 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  30.43 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  30.77 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  35.71 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  35.71 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  34.52 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>