91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1441 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1441  DoxX family protein  100 
 
 		 140 aa  259  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0421253  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  48.09 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  46.39 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  39.26 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  40.82 
 
 		 239 aa  66.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  37.5 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  29.22 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  55.77 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  39.82 
 
 		 283 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  34.75 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  41.67 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  42.99 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  36 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  29.93 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  37.65 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  36.36 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  32.38 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  35.11 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  36.8 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  36.36 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  37.5 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  32.14 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  33.57 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  31.09 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  32.58 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  32.84 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  33.6 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  29.85 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  35.83 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  34.85 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  31.82 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  33.6 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  40.85 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  33.06 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  33.07 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  34.86 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  33.6 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  44.07 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  44.07 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  32 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  31.91 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  44.07 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  31.36 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  33.6 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1118  DoxX family protein  32.22 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000073687  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  32.8 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  33.08 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  30.77 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  33.6 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1096  DoxX family protein  32.22 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000704586  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  38.58 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  30.4 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2898  DoxX  30.5 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  41.33 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  38.75 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  41.33 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  37.62 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  45.76 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  29.2 
 
 		 188 aa  43.9  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  36.59 
 
 		 199 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  33.98 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  33.06 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  36.89 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  31.45 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  52.5 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  32.53 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  29 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  36.07 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.66 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  30.33 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  28.68 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  33.82 
 
 		 148 aa  42  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  27.91 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  38.82 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  40.68 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  28.69 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  40.98 
 
 		 137 aa  42  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  29 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  32.48 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  34.09 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7103  membrane protein-like protein  42.11 
 
 		 274 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0284087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  37.4 
 
 		 135 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  27.13 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  37.21 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  27.91 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  31.63 
 
 		 134 aa  40.8  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  27.87 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  30.11 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  34.07 
 
 		 216 aa  40.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  37.23 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  41.51 
 
 		 196 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>