17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7103 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7103  membrane protein-like protein  100 
 
 		 274 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0284087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  42.95 
 
 		 239 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  40.3 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  46.72 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  29.29 
 
 		 143 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  33.33 
 
 		 148 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  37.72 
 
 		 146 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  40.77 
 
 		 149 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  35.66 
 
 		 133 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  33.59 
 
 		 198 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  33.59 
 
 		 150 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  31.82 
 
 		 164 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  31.91 
 
 		 155 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  31.67 
 
 		 134 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  31.91 
 
 		 137 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  31.4 
 
 		 133 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  33.07 
 
 		 137 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>