162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7264 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  100 
 
 
216 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  53.96 
 
 
239 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  51.15 
 
 
141 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7103  membrane protein-like protein  38.91 
 
 
274 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0284087  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  51.59 
 
 
144 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  46.51 
 
 
143 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  48.36 
 
 
146 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  45.8 
 
 
150 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  47.24 
 
 
144 aa  88.2  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  49.47 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  39.17 
 
 
148 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  44.63 
 
 
147 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  38.46 
 
 
171 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  40.88 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  45.6 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  41.07 
 
 
177 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  38.06 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  36.07 
 
 
149 aa  62  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  37.21 
 
 
134 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  35.48 
 
 
133 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  36.92 
 
 
164 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  50 
 
 
143 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1441  DoxX family protein  46.81 
 
 
140 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0421253  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  37.4 
 
 
149 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  34.68 
 
 
133 aa  59.3  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  36.22 
 
 
155 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  38.84 
 
 
147 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  34.04 
 
 
137 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  36.22 
 
 
137 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  32.62 
 
 
145 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  39.53 
 
 
153 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  38.76 
 
 
180 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  36.59 
 
 
127 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  39.53 
 
 
153 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  37.69 
 
 
173 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  35.16 
 
 
133 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  34.43 
 
 
133 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  36.72 
 
 
148 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  32.82 
 
 
137 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  33.11 
 
 
378 aa  55.1  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  34.38 
 
 
148 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  32.06 
 
 
136 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  38.06 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  38.06 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  36 
 
 
161 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  38.06 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  35.94 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  31.97 
 
 
139 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  33.33 
 
 
137 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  34.13 
 
 
145 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  34.45 
 
 
144 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  39.55 
 
 
145 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  34.13 
 
 
145 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.38 
 
 
147 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  38.69 
 
 
161 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  38.69 
 
 
161 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  38.69 
 
 
161 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  33.6 
 
 
144 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  32.52 
 
 
137 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  34.09 
 
 
149 aa  51.6  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  37.8 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  37.8 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  32.52 
 
 
137 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  37.8 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  38.46 
 
 
164 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  34.13 
 
 
145 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  38.81 
 
 
145 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  44.44 
 
 
137 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  38.76 
 
 
153 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  30.66 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  38.3 
 
 
161 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  34.13 
 
 
144 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  33.85 
 
 
143 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  31.78 
 
 
151 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  35.4 
 
 
137 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  36.09 
 
 
148 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  33.33 
 
 
164 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  34.71 
 
 
144 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  42.53 
 
 
142 aa  48.9  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  33.33 
 
 
160 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  34.07 
 
 
154 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  33.33 
 
 
160 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  34.88 
 
 
148 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  37.96 
 
 
161 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  39.08 
 
 
198 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  34.38 
 
 
139 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  34.78 
 
 
2272 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  34.21 
 
 
2179 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  33.07 
 
 
140 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  37.01 
 
 
149 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  34.15 
 
 
164 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  34.15 
 
 
140 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  34.15 
 
 
164 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  33.33 
 
 
405 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  34.15 
 
 
140 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  35.48 
 
 
138 aa  46.6  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  31.03 
 
 
174 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  34.15 
 
 
140 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  34.15 
 
 
140 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  34.15 
 
 
140 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>