More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1306 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1306  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3673  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  85.42 
 
 		 198 aa  344  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5901  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  80.3 
 
 		 198 aa  339  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3426  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  79.7 
 
 		 198 aa  334  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3743  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  63.59 
 
 		 201 aa  262  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1984  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  62.03 
 
 		 199 aa  255  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.440019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1876  isopropylmalate isomerase small subunit  46.11 
 
 		 192 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  47.67 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  46.89 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.11 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  46.07 
 
 		 191 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  45.08 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  43.52 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  46.91 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0186  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.74 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  44 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.68 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  46.63 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  44.56 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  46.39 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  43.88 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  44.39 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  45.03 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  45.26 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  45.2 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  41.45 
 
 		 201 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  41.45 
 
 		 201 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  44.85 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.57 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  44.56 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  43.72 
 
 		 216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  45.08 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.85 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  44.85 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  45.6 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  48.02 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  44.56 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  42.05 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0627  isopropylmalate isomerase small subunit  47.19 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  45.56 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  44.56 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  45.6 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  46.15 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3620  isopropylmalate isomerase small subunit  43.59 
 
 		 195 aa  161  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  45.64 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  45.64 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2260  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.53 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  42.29 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  41.79 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  43.78 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  43.92 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  41.95 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  41.95 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.81 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  44.27 
 
 		 722 aa  159  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.9 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  43.68 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4052  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.59 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3335  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.15 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1259  isopropylmalate isomerase small subunit  43.15 
 
 		 195 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0512287  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48 
 
 		 195 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  47.46 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  43.22 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  44.33 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  43.22 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  43.52 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  42.71 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  41.29 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  43.65 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4998  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  43.3 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.01 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  44 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  43.43 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  44.33 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  44 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  45.1 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  43.98 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  41.92 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  42.21 
 
 		 217 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  42.05 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.58 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  41.92 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  43.63 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  43.63 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0626  isopropylmalate isomerase small subunit  39.9 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1574  isopropylmalate isomerase small subunit  43.15 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  43.63 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  43.63 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  43.63 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.09 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0776  isopropylmalate isomerase small subunit  39.9 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  43.63 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  43.63 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.36 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>