More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4440 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 
196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 
204 aa  242  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  56.93 
 
 
204 aa  231  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  56.7 
 
 
191 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  56.7 
 
 
191 aa  224  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1876  isopropylmalate isomerase small subunit  57.59 
 
 
192 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  56.7 
 
 
191 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  57.5 
 
 
204 aa  214  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3335  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.48 
 
 
192 aa  191  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  48.72 
 
 
209 aa  187  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3743  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.42 
 
 
201 aa  186  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  48.02 
 
 
216 aa  185  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.24 
 
 
201 aa  185  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  48.54 
 
 
215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1984  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.7 
 
 
199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.440019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  45.36 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  47.45 
 
 
201 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  43.9 
 
 
214 aa  182  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.06 
 
 
195 aa  182  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  46.7 
 
 
200 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  46.67 
 
 
201 aa  180  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  48.65 
 
 
211 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  45.99 
 
 
195 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3673  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.28 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  45.5 
 
 
200 aa  178  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  46.8 
 
 
212 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  45.5 
 
 
216 aa  177  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  46.6 
 
 
201 aa  177  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3620  isopropylmalate isomerase small subunit  44.97 
 
 
195 aa  176  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  47.18 
 
 
201 aa  176  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  46.15 
 
 
201 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.32 
 
 
215 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  45.5 
 
 
216 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  45.13 
 
 
201 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  46.07 
 
 
201 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0284  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.92 
 
 
195 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0044602  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  45.08 
 
 
201 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  44.17 
 
 
216 aa  175  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.03 
 
 
195 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  45.64 
 
 
201 aa  174  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4709  isopropylmalate isomerase small subunit  46.84 
 
 
192 aa  174  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1533  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.46 
 
 
202 aa  174  8e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.721417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  45.41 
 
 
201 aa  174  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  46.56 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.56 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  46.56 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  46.56 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  46.56 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  45.03 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  47.85 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  45.03 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  46.56 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  47.47 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  44.44 
 
 
215 aa  173  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.83 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 
200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  44.39 
 
 
216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  45.15 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  47.31 
 
 
202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  46.56 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  44.17 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  47.43 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  47.43 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  47.43 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  44.39 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  45.36 
 
 
722 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  43.98 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.88 
 
 
212 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  45.15 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.83 
 
 
216 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  45 
 
 
214 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.67 
 
 
201 aa  171  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  43.88 
 
 
201 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  43.84 
 
 
212 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  43.88 
 
 
201 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  45.81 
 
 
212 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4998  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.39 
 
 
198 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.78 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  43.84 
 
 
212 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  44.62 
 
 
200 aa  170  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  46.28 
 
 
214 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  43.75 
 
 
215 aa  170  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  46.77 
 
 
202 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  42.23 
 
 
216 aa  170  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  47.64 
 
 
212 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  43.84 
 
 
218 aa  170  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  45.37 
 
 
216 aa  170  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1306  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.68 
 
 
198 aa  170  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  45.37 
 
 
216 aa  170  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  48.69 
 
 
216 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  46.77 
 
 
201 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  46.28 
 
 
213 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0627  isopropylmalate isomerase small subunit  43.32 
 
 
195 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  46.81 
 
 
214 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  46.77 
 
 
201 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  43.88 
 
 
201 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  47.31 
 
 
201 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.36 
 
 
202 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1259  isopropylmalate isomerase small subunit  42.78 
 
 
195 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0512287  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 
200 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>