More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2092 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 216 aa  447  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  73.93 
 
 		 215 aa  330  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  71.09 
 
 		 215 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  69.19 
 
 		 214 aa  307  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  69.19 
 
 		 214 aa  307  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  69.19 
 
 		 214 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  69.67 
 
 		 215 aa  306  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  68.72 
 
 		 218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  68.72 
 
 		 214 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  69.19 
 
 		 214 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  69.67 
 
 		 212 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  69.67 
 
 		 212 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  68.08 
 
 		 215 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  67.44 
 
 		 240 aa  301  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2085  isopropylmalate isomerase small subunit  67.3 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  67.61 
 
 		 215 aa  299  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  69.19 
 
 		 215 aa  299  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  67.92 
 
 		 213 aa  298  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  67.3 
 
 		 213 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  67.62 
 
 		 216 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  64.93 
 
 		 216 aa  295  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  67.62 
 
 		 216 aa  295  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  64.93 
 
 		 216 aa  294  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  65.71 
 
 		 215 aa  294  8e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  67.14 
 
 		 216 aa  293  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  67.3 
 
 		 213 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  67.77 
 
 		 212 aa  292  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  65.88 
 
 		 214 aa  292  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  66.04 
 
 		 212 aa  292  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  66.98 
 
 		 215 aa  291  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  64.45 
 
 		 216 aa  291  6e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  64.76 
 
 		 215 aa  288  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  65.88 
 
 		 214 aa  288  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  63.33 
 
 		 216 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  64.29 
 
 		 216 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  63.33 
 
 		 216 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  66.82 
 
 		 217 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  65.24 
 
 		 216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  64.76 
 
 		 216 aa  284  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  64.76 
 
 		 216 aa  284  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  64.76 
 
 		 216 aa  284  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  63.81 
 
 		 216 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  63.81 
 
 		 216 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  63.81 
 
 		 216 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  63.81 
 
 		 216 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  64.29 
 
 		 216 aa  284  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  63.81 
 
 		 216 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  63.81 
 
 		 216 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  63.81 
 
 		 216 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  64.76 
 
 		 216 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  65.4 
 
 		 217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  64.76 
 
 		 216 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  65.4 
 
 		 217 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  66.19 
 
 		 216 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  66.19 
 
 		 216 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  64.76 
 
 		 216 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  64.45 
 
 		 212 aa  280  9e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  65.88 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  63.21 
 
 		 216 aa  279  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  64.29 
 
 		 216 aa  278  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  63.33 
 
 		 217 aa  278  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  63.51 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  63.51 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  63.33 
 
 		 216 aa  275  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  62.56 
 
 		 214 aa  274  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  63.03 
 
 		 212 aa  274  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  64.93 
 
 		 217 aa  274  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  62.86 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  62.38 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  62.38 
 
 		 216 aa  269  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.72 
 
 		 215 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.72 
 
 		 215 aa  268  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  61.9 
 
 		 215 aa  267  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  59.52 
 
 		 201 aa  262  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.87 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.05 
 
 		 201 aa  256  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  58.57 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  58.57 
 
 		 201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  60.1 
 
 		 200 aa  250  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  59.61 
 
 		 200 aa  250  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  56.19 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2731  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  58.77 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.413417  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  59.61 
 
 		 200 aa  249  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.14 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  59.11 
 
 		 200 aa  247  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  57.14 
 
 		 201 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  56.19 
 
 		 201 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  56.19 
 
 		 201 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  55.71 
 
 		 201 aa  244  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  54.76 
 
 		 201 aa  244  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  58.13 
 
 		 200 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  57.92 
 
 		 200 aa  241  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  54.76 
 
 		 201 aa  240  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  53.11 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  54.55 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  54.07 
 
 		 201 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  52.63 
 
 		 201 aa  238  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  54.07 
 
 		 201 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  54.76 
 
 		 722 aa  238  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>