More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0742 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 
200 aa  416  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  87.5 
 
 
200 aa  370  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  86.93 
 
 
200 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  87 
 
 
200 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  86.43 
 
 
200 aa  363  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  84.42 
 
 
200 aa  355  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  84.92 
 
 
200 aa  356  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  84.42 
 
 
200 aa  355  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  82.83 
 
 
201 aa  347  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  83.25 
 
 
201 aa  345  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  83.25 
 
 
201 aa  345  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  82.74 
 
 
201 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  82.74 
 
 
201 aa  344  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  81.82 
 
 
201 aa  343  7e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  81.82 
 
 
201 aa  343  7e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  81.82 
 
 
201 aa  343  7e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  81.82 
 
 
201 aa  343  7e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  81.82 
 
 
201 aa  343  7e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  81.82 
 
 
201 aa  343  7e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  81.82 
 
 
201 aa  343  7e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  82.74 
 
 
201 aa  343  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  81.22 
 
 
201 aa  340  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  81.22 
 
 
201 aa  338  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  76.88 
 
 
200 aa  335  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  76 
 
 
200 aa  334  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  75.38 
 
 
200 aa  327  9e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  74.87 
 
 
200 aa  323  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  69.35 
 
 
200 aa  304  5.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  65.33 
 
 
201 aa  277  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  65.5 
 
 
201 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  64.82 
 
 
201 aa  270  9e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  63.32 
 
 
201 aa  269  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  64.32 
 
 
201 aa  269  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  62.81 
 
 
201 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  62.81 
 
 
201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  63.32 
 
 
201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  63.32 
 
 
201 aa  264  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  62.81 
 
 
201 aa  264  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  63.59 
 
 
201 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  63.46 
 
 
215 aa  263  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  62 
 
 
201 aa  262  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  63.59 
 
 
201 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  63.59 
 
 
201 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  63.08 
 
 
201 aa  262  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  60.4 
 
 
216 aa  257  7e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  62.56 
 
 
201 aa  257  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  60.59 
 
 
215 aa  255  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  59.02 
 
 
214 aa  254  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  60.49 
 
 
214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  60.71 
 
 
201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  60 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  59.11 
 
 
216 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  58.62 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.61 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  58.62 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  60.77 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  58.62 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 
214 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  60.98 
 
 
214 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  58.74 
 
 
217 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  60.1 
 
 
218 aa  251  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 
214 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 
214 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  59.51 
 
 
216 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 
214 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  58.25 
 
 
217 aa  250  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.61 
 
 
216 aa  250  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  58.54 
 
 
216 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  60.29 
 
 
212 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  58.54 
 
 
216 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  58.82 
 
 
217 aa  250  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  58.54 
 
 
216 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  59.62 
 
 
213 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 
216 aa  249  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  59.02 
 
 
216 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.31 
 
 
240 aa  248  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  58.91 
 
 
216 aa  248  4e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  57.77 
 
 
217 aa  248  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  60.1 
 
 
198 aa  247  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  58.05 
 
 
216 aa  247  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  57.56 
 
 
216 aa  246  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  57.56 
 
 
216 aa  246  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 
216 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 
216 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 
216 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 
216 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 
216 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 
216 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 
216 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3568  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  58.71 
 
 
203 aa  245  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 
216 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  58.42 
 
 
216 aa  245  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  60.1 
 
 
215 aa  245  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 
216 aa  245  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  56.1 
 
 
217 aa  244  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  57.64 
 
 
216 aa  244  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 
216 aa  244  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  59.61 
 
 
216 aa  244  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  59.39 
 
 
208 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  58.13 
 
 
215 aa  244  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>