More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3673 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3673  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1306  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  85.42 
 
 		 198 aa  344  5e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5901  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  81.31 
 
 		 198 aa  339  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3426  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  78.65 
 
 		 198 aa  328  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1984  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  67.36 
 
 		 199 aa  272  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.440019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3743  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  65.79 
 
 		 201 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  51.31 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.28 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  49.22 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.97 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0186  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.91 
 
 		 198 aa  177  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  48.7 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  47.64 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  47.64 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  48.69 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  48.7 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  47.94 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  45.55 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  45.64 
 
 		 191 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  46.6 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  44.56 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  47.12 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  46.67 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  46.63 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  48.19 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  46.6 
 
 		 201 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1876  isopropylmalate isomerase small subunit  45.21 
 
 		 192 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  48.69 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  44.1 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  43.23 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  44.1 
 
 		 191 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  48.45 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  48.19 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  48.69 
 
 		 200 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  43.14 
 
 		 217 aa  168  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  43.68 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  43.68 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  50.28 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  50.28 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.72 
 
 		 201 aa  167  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2260  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.01 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3620  isopropylmalate isomerase small subunit  45.88 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0627  isopropylmalate isomerase small subunit  45.88 
 
 		 195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  44.62 
 
 		 722 aa  165  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  41.87 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  45.88 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  45.08 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  44.61 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  43.35 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  43.84 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  42.16 
 
 		 216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  42.65 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  44.12 
 
 		 216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  43.84 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  42.65 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4998  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.56 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4052  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.36 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3281  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.15 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  43.16 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  42.36 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  43.41 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  41.95 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  42.56 
 
 		 195 aa  160  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1259  isopropylmalate isomerase small subunit  44.85 
 
 		 195 aa  160  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0512287  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.29 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  41.87 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1574  isopropylmalate isomerase small subunit  45.36 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  44.57 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.57 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  41.87 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.57 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  44.06 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.89 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11110  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.88 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  44.1 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  42.44 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0776  isopropylmalate isomerase small subunit  41.41 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0626  isopropylmalate isomerase small subunit  41.41 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  43.78 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  43.08 
 
 		 216 aa  158  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  41.38 
 
 		 218 aa  158  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  41.58 
 
 		 216 aa  157  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3335  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.46 
 
 		 192 aa  157  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.52 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  45.96 
 
 		 772 aa  157  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.78 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  43.5 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  43.78 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  41.87 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  43.75 
 
 		 200 aa  157  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.58 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  44.28 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  42.79 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  41.67 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  43.28 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>