More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0626 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0776  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0626  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  62.09 
 
 		 212 aa  265  5e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  61.68 
 
 		 213 aa  263  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  61.03 
 
 		 214 aa  261  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  61.03 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  60.66 
 
 		 212 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  61.14 
 
 		 212 aa  256  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  58.69 
 
 		 216 aa  252  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  57.28 
 
 		 216 aa  251  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  58.96 
 
 		 216 aa  251  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  62.09 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  58.96 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  58.69 
 
 		 214 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 		 215 aa  248  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  59.43 
 
 		 212 aa  248  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  58.22 
 
 		 214 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2085  isopropylmalate isomerase small subunit  57.35 
 
 		 215 aa  246  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  58.57 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  58.57 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  58.57 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  58.49 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 		 216 aa  245  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  58.29 
 
 		 215 aa  245  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  58.96 
 
 		 212 aa  245  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  57.82 
 
 		 215 aa  245  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  58.22 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  58.22 
 
 		 214 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  55.87 
 
 		 216 aa  244  6e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  55.4 
 
 		 216 aa  244  6.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  59.05 
 
 		 216 aa  244  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  59.05 
 
 		 216 aa  244  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  58.22 
 
 		 213 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  58.57 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  58.22 
 
 		 214 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  59.05 
 
 		 216 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  58.22 
 
 		 213 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  59.05 
 
 		 216 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  59.05 
 
 		 216 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  59.05 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  58.57 
 
 		 215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  56.13 
 
 		 214 aa  241  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  58.77 
 
 		 217 aa  241  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  58.29 
 
 		 217 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  56.87 
 
 		 217 aa  241  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  57.62 
 
 		 217 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  58.57 
 
 		 216 aa  240  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  56.67 
 
 		 216 aa  239  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  56.67 
 
 		 216 aa  239  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  58.29 
 
 		 217 aa  239  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  58.57 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  55.92 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  57.82 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  58.57 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.08 
 
 		 215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  57.62 
 
 		 216 aa  236  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  55.45 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  58.77 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.92 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  234  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  56.19 
 
 		 216 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2731  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.5 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.413417  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.45 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  56.87 
 
 		 215 aa  232  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  54.98 
 
 		 212 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.6 
 
 		 216 aa  231  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  55.66 
 
 		 216 aa  231  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  59.69 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.69 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  59.69 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  59.69 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  59.69 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  56.87 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  59.69 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  59.69 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  59.18 
 
 		 201 aa  228  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  59.18 
 
 		 201 aa  228  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.76 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  54.29 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  57.65 
 
 		 201 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  57.65 
 
 		 201 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  57.14 
 
 		 201 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  57.65 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  57.14 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  57.14 
 
 		 201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  57.36 
 
 		 200 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  57.36 
 
 		 200 aa  221  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  56.35 
 
 		 200 aa  221  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  51.96 
 
 		 201 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  52.94 
 
 		 201 aa  218  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  53.92 
 
 		 207 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.43 
 
 		 201 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3568  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.82 
 
 		 203 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>