More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3335 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3335  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  55.08 
 
 		 191 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  55.08 
 
 		 191 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1876  isopropylmalate isomerase small subunit  54.79 
 
 		 192 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  55.08 
 
 		 191 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0284  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.34 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0044602  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  49.48 
 
 		 204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  52.49 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  48.97 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.48 
 
 		 196 aa  191  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.63 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  44.39 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  45.83 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  46.8 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  43.88 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  43.59 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  43.88 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  44.56 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  44.39 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  44.62 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.33 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  42.56 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.88 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  42.56 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.39 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  46.15 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  44.83 
 
 		 214 aa  175  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  45.54 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  46.04 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  46.04 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  45.64 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  46.04 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  46.04 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  46.04 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  46.04 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  46.04 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  46.67 
 
 		 201 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  43.88 
 
 		 201 aa  174  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  44.83 
 
 		 214 aa  174  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  46.67 
 
 		 201 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  43.84 
 
 		 214 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  46.67 
 
 		 201 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  43.88 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  44.55 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3743  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.31 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  43.35 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  44.04 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  43.52 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  43.37 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  46.67 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  43.41 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  43.35 
 
 		 214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  43.52 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  45.64 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  43.52 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  44.06 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  43.59 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  43.3 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  46.15 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  44.33 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  44.06 
 
 		 216 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  43.84 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.04 
 
 		 201 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  44.39 
 
 		 200 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  44.62 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  46.81 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  44.62 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.59 
 
 		 195 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  44.39 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 216 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 214 aa  170  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 216 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 216 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  43.07 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  42.49 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.28 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  42.57 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.79 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  43.35 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  46.15 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  45.64 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  42.57 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  43.35 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1984  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.32 
 
 		 199 aa  168  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.440019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  43.59 
 
 		 202 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  43.35 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  43.59 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  45.79 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  44.06 
 
 		 216 aa  168  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  45.88 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  44.62 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  45.88 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.84 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  45.03 
 
 		 200 aa  167  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>