More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0215 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 202 aa  418  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  59.2 
 
 		 201 aa  252  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  58.71 
 
 		 201 aa  250  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  57.71 
 
 		 201 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  57.71 
 
 		 201 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  58.21 
 
 		 201 aa  248  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.72 
 
 		 201 aa  248  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.21 
 
 		 201 aa  244  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  58.71 
 
 		 201 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  55.72 
 
 		 201 aa  240  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  56 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  56 
 
 		 201 aa  237  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  56.5 
 
 		 200 aa  237  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  55.5 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  56.22 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  56.22 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  57 
 
 		 200 aa  235  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  55.5 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  55.5 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  55 
 
 		 211 aa  235  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  55.5 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  55.5 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  55 
 
 		 209 aa  234  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  56.22 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  57.21 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  56 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  57.21 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  56.72 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  55 
 
 		 202 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  55 
 
 		 201 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.37 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  54.5 
 
 		 200 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  54 
 
 		 202 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  54.5 
 
 		 201 aa  228  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3281  isopropylmalate isomerase small subunit  55 
 
 		 207 aa  224  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  53.73 
 
 		 207 aa  223  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.19 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  53.5 
 
 		 722 aa  220  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  52.36 
 
 		 212 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.13 
 
 		 240 aa  211  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24772  predicted protein  49.29 
 
 		 801 aa  211  5.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2085  isopropylmalate isomerase small subunit  52.36 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  50.71 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  50.95 
 
 		 216 aa  208  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  51.22 
 
 		 762 aa  207  7e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 218 aa  207  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  50.71 
 
 		 212 aa  207  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  50.95 
 
 		 215 aa  207  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  55.38 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.24 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  50.95 
 
 		 214 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 214 aa  205  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  51.43 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  51.9 
 
 		 216 aa  205  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  51.43 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  51.9 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  51.52 
 
 		 197 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  49.06 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 215 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  49.52 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.57 
 
 		 215 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  49.29 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.57 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 212 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  48.1 
 
 		 216 aa  201  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  48.57 
 
 		 216 aa  201  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  53.33 
 
 		 197 aa  201  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  49.05 
 
 		 216 aa  201  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  54.36 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  49.53 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2315  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.49 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.566047  normal  0.0819697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  47.62 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  47.62 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  49.52 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  49.53 
 
 		 215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  48.57 
 
 		 216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  49.52 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  52.82 
 
 		 201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  50.49 
 
 		 772 aa  198  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  49.52 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  47.62 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4709  isopropylmalate isomerase small subunit  52 
 
 		 192 aa  198  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.05 
 
 		 213 aa  197  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  52.82 
 
 		 201 aa  197  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  49.05 
 
 		 215 aa  197  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.52 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.52 
 
 		 204 aa  197  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  52.31 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  49.53 
 
 		 215 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  48.1 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  52.82 
 
 		 201 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  53.06 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  50.77 
 
 		 201 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>