More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1246 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  70.94 
 
 		 204 aa  305  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  67.98 
 
 		 204 aa  295  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  59.79 
 
 		 191 aa  242  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  59.28 
 
 		 191 aa  242  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  59.28 
 
 		 191 aa  242  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1876  isopropylmalate isomerase small subunit  58.64 
 
 		 192 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.5 
 
 		 196 aa  229  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.72 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  49.76 
 
 		 216 aa  207  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.76 
 
 		 202 aa  206  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  50.25 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  49.27 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  49.26 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  49.27 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  49.26 
 
 		 214 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 214 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 201 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3335  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.51 
 
 		 192 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  47.34 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  50.75 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  50.25 
 
 		 215 aa  201  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  49.27 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  50.74 
 
 		 212 aa  200  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  47.42 
 
 		 201 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  50.79 
 
 		 207 aa  200  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  46.86 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  48.96 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  48.28 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  49.21 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  47.78 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  48.28 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  49.22 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  48.29 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  48.28 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  48.26 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  47.92 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  47.64 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  46.94 
 
 		 209 aa  195  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  45.92 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  49.26 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  48.76 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  46.54 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 		 201 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  47.45 
 
 		 201 aa  194  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 		 201 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.64 
 
 		 201 aa  194  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  47.78 
 
 		 216 aa  194  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  47.78 
 
 		 216 aa  194  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 216 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 216 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  45.92 
 
 		 201 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  47.24 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.78 
 
 		 213 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  51.01 
 
 		 197 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 216 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  47.26 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  48.47 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  48.77 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  49.48 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.12 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  51.28 
 
 		 197 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 215 aa  191  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  44.83 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  49.49 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  46.23 
 
 		 202 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.8 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  45.41 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.28 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  47 
 
 		 212 aa  191  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.28 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  47.76 
 
 		 216 aa  191  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.17 
 
 		 201 aa  191  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  48.98 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  48.98 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 201 aa  191  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  48.76 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  48.26 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  47.12 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  48.22 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  48.76 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  47.72 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  48.76 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2085  isopropylmalate isomerase small subunit  44.88 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3281  isopropylmalate isomerase small subunit  49.02 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  47.03 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>