More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0862 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 197 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  84.62 
 
 		 197 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  61.22 
 
 		 202 aa  255  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  57.51 
 
 		 201 aa  225  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  55.34 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  55.34 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  54.37 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  56.41 
 
 		 201 aa  222  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  56.93 
 
 		 218 aa  221  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3568  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.96 
 
 		 203 aa  220  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  55.67 
 
 		 213 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  56.44 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  56.8 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.41 
 
 		 240 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  54.95 
 
 		 216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  55.5 
 
 		 216 aa  217  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  55.5 
 
 		 216 aa  217  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  55.61 
 
 		 200 aa  217  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  55.17 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  53.5 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  56.16 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  57.43 
 
 		 212 aa  215  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  53.96 
 
 		 216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  56.16 
 
 		 214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  56.65 
 
 		 214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  53 
 
 		 215 aa  214  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  54.59 
 
 		 200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  56.16 
 
 		 214 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  54.19 
 
 		 215 aa  214  9e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  54.08 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  54.5 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  54.08 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  55.67 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  53.96 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  55.67 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  54.5 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.96 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  56.16 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  53.33 
 
 		 201 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1287  isopropylmalate isomerase small subunit  55.73 
 
 		 193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  54.31 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.12 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.79 
 
 		 195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1494  isopropylmalate isomerase small subunit  55.73 
 
 		 193 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.79 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  54 
 
 		 217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1314  isopropylmalate isomerase small subunit  55.73 
 
 		 193 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  55.45 
 
 		 214 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  53.57 
 
 		 200 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1423  isopropylmalate isomerase small subunit  55.73 
 
 		 193 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  55.73 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.69 
 
 		 213 aa  211  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  55 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  53.69 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  53.03 
 
 		 201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  55 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  56.78 
 
 		 212 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  52.5 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  52.82 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  56.77 
 
 		 193 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  54 
 
 		 216 aa  211  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.19 
 
 		 213 aa  210  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  54 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  53.5 
 
 		 216 aa  209  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  56.25 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  54 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.74 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  52.82 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  54.97 
 
 		 193 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  52.82 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  52.82 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  52.82 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  55 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  53 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  53 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  52.85 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  53 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  52.55 
 
 		 200 aa  208  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1288  isopropylmalate isomerase small subunit  54.69 
 
 		 193 aa  208  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  54.23 
 
 		 217 aa  208  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  52.85 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  53.5 
 
 		 216 aa  207  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  52.31 
 
 		 201 aa  207  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  52.5 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  52.5 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  52.5 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  53 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  52.5 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  52.5 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  52.5 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  53.73 
 
 		 217 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  52.5 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  54.46 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.69 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  53.33 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  52.5 
 
 		 216 aa  205  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  52.28 
 
 		 200 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  52.31 
 
 		 201 aa  205  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  51.81 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>