More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1984 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 191 aa  386  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  99.48 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  96.86 
 
 		 191 aa  377  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1876  isopropylmalate isomerase small subunit  82.35 
 
 		 192 aa  332  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  60.31 
 
 		 204 aa  248  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  58.25 
 
 		 204 aa  238  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  59.56 
 
 		 204 aa  230  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.7 
 
 		 196 aa  224  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3335  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.08 
 
 		 192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0284  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.23 
 
 		 195 aa  209  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0044602  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  48.69 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  52.25 
 
 		 201 aa  194  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  48.04 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  47.64 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 		 200 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  47.12 
 
 		 209 aa  191  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  47.12 
 
 		 201 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  52.81 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  52.81 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  47.12 
 
 		 201 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  47.12 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  46.8 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  52.81 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.64 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.21 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  49.73 
 
 		 216 aa  188  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  48.04 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  50.56 
 
 		 211 aa  188  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  50.56 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  49.21 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  46.8 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.74 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  46.07 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  47.42 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  45.13 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  49.72 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  47.55 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  51.69 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  48.02 
 
 		 212 aa  185  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  51.69 
 
 		 202 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.56 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.57 
 
 		 212 aa  185  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3743  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.96 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.17 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 		 213 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 		 200 aa  184  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  47.29 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 		 214 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  51.12 
 
 		 202 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  47.29 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  46.57 
 
 		 212 aa  184  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  47.37 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 		 214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  47.57 
 
 		 218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  47.64 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.74 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  45.83 
 
 		 722 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  48.7 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  47.06 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  47.29 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  47.29 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.59 
 
 		 215 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  47.12 
 
 		 214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  47.12 
 
 		 214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  46.91 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  44.83 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  46.8 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  46.31 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  43.14 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  45.81 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.46 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.36 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  46.8 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  47.64 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.32 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  47.67 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  48.29 
 
 		 215 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.1 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  48.68 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  47.4 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  47.12 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  47.06 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  46.31 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  45.32 
 
 		 216 aa  177  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  47.59 
 
 		 216 aa  177  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.41 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  45.32 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  47.59 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  45.32 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  48.9 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  46.88 
 
 		 201 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  46.88 
 
 		 201 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.94 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  45.32 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  45.32 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  45.32 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  45.32 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  45.32 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>