More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0279 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  61.98 
 
 		 195 aa  245  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3620  isopropylmalate isomerase small subunit  59.38 
 
 		 195 aa  236  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.73 
 
 		 197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.87 
 
 		 195 aa  232  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1533  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.63 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.721417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  55.9 
 
 		 195 aa  225  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1590  isopropylmalate isomerase small subunit  56.25 
 
 		 197 aa  222  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.494308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8048  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.36 
 
 		 199 aa  217  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0627  isopropylmalate isomerase small subunit  53.65 
 
 		 195 aa  217  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0186  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.06 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4052  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.59 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4998  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  53.85 
 
 		 198 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3297  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.26 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08750  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.79 
 
 		 201 aa  204  9e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00132575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8017  isopropylmalate isomerase small subunit  53.12 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2255  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.78 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1259  isopropylmalate isomerase small subunit  51.03 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0512287  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2518  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09070  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.08 
 
 		 197 aa  201  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.656133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1597  isopropylmalate isomerase small subunit  52.85 
 
 		 230 aa  201  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  50.75 
 
 		 201 aa  201  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18550  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50 
 
 		 204 aa  201  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 201 aa  200  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  48.74 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11110  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.23 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2315  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.26 
 
 		 222 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  50.25 
 
 		 207 aa  197  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1922  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1968  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2356  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.26 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4709  isopropylmalate isomerase small subunit  55.14 
 
 		 192 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1902  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 		 197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4226  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  48.51 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 197 aa  195  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  48.82 
 
 		 212 aa  195  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  47.74 
 
 		 200 aa  195  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.75 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  51.26 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  47.24 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2136  isopropylmalate isomerase small subunit  48.72 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  47.98 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  47.98 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  48.48 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  48.48 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  47.6 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50 
 
 		 195 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  49.04 
 
 		 218 aa  192  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1479  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.4 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.113281  normal  0.730621 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  47.87 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  48.74 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  48.48 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  46.73 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  48.69 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.47 
 
 		 201 aa  191  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 216 aa  191  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1359  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.96 
 
 		 201 aa  191  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.778348  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  50.5 
 
 		 197 aa  191  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  46.73 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1173  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 		 202 aa  191  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  48.74 
 
 		 202 aa  191  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  46.92 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  46.92 
 
 		 216 aa  191  7e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 		 216 aa  191  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 		 216 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  46.73 
 
 		 200 aa  190  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  46.23 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3568  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.01 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46.23 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  46.8 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6005  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.4 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0588518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.6 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1167  isopropylmalate isomerase small subunit  49.24 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000149275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1150  isopropylmalate isomerase small subunit  51.55 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000354633 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  49.04 
 
 		 216 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  49.29 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1574  isopropylmalate isomerase small subunit  47.69 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  49.52 
 
 		 216 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.26 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  49.52 
 
 		 216 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  50.74 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  47.26 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.04 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  47.78 
 
 		 216 aa  187  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>