More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3743 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3743  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5901  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  64.62 
 
 		 198 aa  266  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1984  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  62.18 
 
 		 199 aa  262  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.440019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1306  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  63.59 
 
 		 198 aa  262  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3673  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  65.79 
 
 		 198 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3426  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  61.9 
 
 		 198 aa  249  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1876  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 192 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.42 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  47.96 
 
 		 191 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  48.73 
 
 		 191 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  46.7 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  47.96 
 
 		 191 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  47.78 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  48.45 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  48.21 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  48.21 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  48.21 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  49.22 
 
 		 200 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  45.13 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  44.79 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  47.21 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  46.7 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.39 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  46.7 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.69 
 
 		 198 aa  177  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  46.39 
 
 		 200 aa  177  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.42 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  43.75 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  46.04 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  46.39 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  46.39 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  48.7 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  47.03 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  47.15 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  48.7 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.78 
 
 		 194 aa  175  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  48.19 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  44.39 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.55 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 200 aa  174  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  45.77 
 
 		 217 aa  174  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  45.54 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  45.83 
 
 		 722 aa  174  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  48.19 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  48.19 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  46.15 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  47.15 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  47.15 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.15 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3335  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.31 
 
 		 192 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  47.15 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  47.15 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  44.28 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  46.39 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  47.15 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  47.15 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  45.08 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  42.42 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  45.6 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  45.6 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  45.77 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  44.06 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  46.53 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  43.28 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  47.67 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  43.78 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  43.78 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  44.56 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  47.31 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  43.28 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  43.28 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  43.78 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  46.91 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  43.56 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.85 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  46.45 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  46.63 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  43.28 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.66 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  44.85 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  42.44 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  46.67 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0186  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.88 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  45.6 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  47.83 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  45.13 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.23 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  42.49 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  43.78 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  43.5 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  42.29 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  44.62 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  44.55 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  47.15 
 
 		 200 aa  167  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>