More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0078 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 201 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  99.5 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  99.5 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  99.5 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  99.5 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  98.51 
 
 		 201 aa  413  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  99.5 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  99.5 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  99 
 
 		 201 aa  411  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  90.55 
 
 		 201 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  91.54 
 
 		 201 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  91.54 
 
 		 201 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  91.04 
 
 		 201 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  90.55 
 
 		 201 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  88.5 
 
 		 201 aa  377  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  84.34 
 
 		 200 aa  354  5e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  81.82 
 
 		 200 aa  343  8e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  81.73 
 
 		 200 aa  338  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  81.22 
 
 		 200 aa  338  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  81.73 
 
 		 200 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  79.8 
 
 		 200 aa  334  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  79.29 
 
 		 200 aa  334  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  79.29 
 
 		 200 aa  334  5.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  73.1 
 
 		 200 aa  314  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  73.1 
 
 		 200 aa  311  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  72.96 
 
 		 200 aa  311  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  71.57 
 
 		 200 aa  301  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  68.21 
 
 		 200 aa  295  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  63.86 
 
 		 214 aa  265  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  63.5 
 
 		 201 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  63.37 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  63.37 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  62.63 
 
 		 201 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  63.37 
 
 		 214 aa  261  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  62.87 
 
 		 214 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  63.9 
 
 		 215 aa  258  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  62.56 
 
 		 218 aa  257  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  63.32 
 
 		 215 aa  256  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  60.61 
 
 		 201 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  60.2 
 
 		 216 aa  251  5.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  59.9 
 
 		 213 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  59.24 
 
 		 212 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  60.91 
 
 		 198 aa  250  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  60.19 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  60.2 
 
 		 201 aa  248  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  62.38 
 
 		 216 aa  248  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  60.61 
 
 		 201 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  58.21 
 
 		 201 aa  248  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  58.79 
 
 		 201 aa  248  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.41 
 
 		 213 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  59.8 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  59.5 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  59.42 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  59.5 
 
 		 201 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  61.5 
 
 		 215 aa  244  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  60.31 
 
 		 208 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  59.09 
 
 		 201 aa  244  9e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  58 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  58 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  58 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  58 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  58.13 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  58.45 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  61.11 
 
 		 212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  58.54 
 
 		 217 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  58.94 
 
 		 216 aa  241  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  59.22 
 
 		 216 aa  241  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  58.94 
 
 		 216 aa  241  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  58.94 
 
 		 216 aa  241  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  57 
 
 		 201 aa  241  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  59.51 
 
 		 217 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  59.51 
 
 		 217 aa  241  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  58.74 
 
 		 216 aa  240  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  58.82 
 
 		 216 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  58.94 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  59.41 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  58.74 
 
 		 216 aa  239  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  58.82 
 
 		 216 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  57.5 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  57.35 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  57.84 
 
 		 212 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  57.43 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  57.43 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  57.35 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  60.91 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.5 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  60.1 
 
 		 212 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  57.28 
 
 		 216 aa  237  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  58.42 
 
 		 212 aa  237  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  56.37 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  57.84 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  57.84 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  57.84 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  58.42 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  57.84 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  56.44 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  57.43 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  57.84 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  57.84 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  57.84 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>