More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3426 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3426  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 198 aa  410  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.278995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1306  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  79.7 
 
 		 198 aa  334  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3673  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  78.65 
 
 		 198 aa  328  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5901  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  76.77 
 
 		 198 aa  327  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1984  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  65.24 
 
 		 199 aa  265  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.440019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3743  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  61.9 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  45.88 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  48.42 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  46.32 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  48.02 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  46.32 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  45.26 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  45.36 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0186  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.84 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  45.26 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  46.89 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  46.32 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  46.32 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  44.04 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  46.84 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  43.01 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  43.01 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.46 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  45.88 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  44.21 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.3 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  46.11 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.62 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 211 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  43.68 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  44.62 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  45.79 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  45.26 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3281  isopropylmalate isomerase small subunit  45.26 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  45.51 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.33 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.21 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  45.21 
 
 		 191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  45.21 
 
 		 191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  42.56 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  45.13 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  47.85 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  45.74 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1876  isopropylmalate isomerase small subunit  43.62 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.14 
 
 		 195 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  44.62 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  44.62 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.62 
 
 		 196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  46.33 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  46.33 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  44.57 
 
 		 216 aa  160  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  42.64 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  44.32 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  44.32 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  44.86 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  41.54 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  43.3 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  42.33 
 
 		 722 aa  158  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3620  isopropylmalate isomerase small subunit  44.63 
 
 		 195 aa  158  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4052  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.59 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  43.85 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  47.4 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  42.21 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  45.7 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.16 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  41.54 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  44.62 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  42.21 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  43.65 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0627  isopropylmalate isomerase small subunit  46.63 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  44.57 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  42.93 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.04 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  41.71 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  41.71 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  41.71 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  41.71 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  41.71 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  41.71 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  44.86 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  41.71 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  40.5 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  42.21 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  42.21 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.5 
 
 		 195 aa  154  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0776  isopropylmalate isomerase small subunit  43.33 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  42.21 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0626  isopropylmalate isomerase small subunit  43.33 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  43.08 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.21 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  40.7 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1259  isopropylmalate isomerase small subunit  43.16 
 
 		 195 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0512287  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  40.7 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  44.44 
 
 		 218 aa  153  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  40.2 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.93 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.92 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>