More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0627 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0627  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 195 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0186  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  80.71 
 
 		 198 aa  324  6e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1590  isopropylmalate isomerase small subunit  73.33 
 
 		 197 aa  300  8.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.494308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  74.74 
 
 		 195 aa  299  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  73.71 
 
 		 195 aa  299  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8048  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  70.62 
 
 		 199 aa  285  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11110  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  70.1 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2315  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  68.04 
 
 		 222 aa  281  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09070  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  69.59 
 
 		 197 aa  280  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.656133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1574  isopropylmalate isomerase small subunit  67.01 
 
 		 212 aa  280  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2356  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  69.07 
 
 		 213 aa  278  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6005  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  66.15 
 
 		 200 aa  278  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0588518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18550  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  67.69 
 
 		 204 aa  276  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3297  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  65.66 
 
 		 202 aa  274  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  69.07 
 
 		 195 aa  273  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2518  isopropylmalate isomerase small subunit  65.98 
 
 		 200 aa  270  8.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8017  isopropylmalate isomerase small subunit  69.07 
 
 		 195 aa  270  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4998  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  68.04 
 
 		 198 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3214  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  65.46 
 
 		 197 aa  270  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0199989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4052  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  66.32 
 
 		 203 aa  267  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3620  isopropylmalate isomerase small subunit  67.01 
 
 		 195 aa  266  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1359  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  64.43 
 
 		 201 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.778348  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4226  isopropylmalate isomerase small subunit  64.95 
 
 		 197 aa  265  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1922  isopropylmalate isomerase small subunit  65.46 
 
 		 197 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1968  isopropylmalate isomerase small subunit  65.46 
 
 		 197 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2255  isopropylmalate isomerase small subunit  65.46 
 
 		 200 aa  264  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1902  isopropylmalate isomerase small subunit  64.95 
 
 		 197 aa  264  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2136  isopropylmalate isomerase small subunit  64.43 
 
 		 197 aa  260  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2847  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  64.43 
 
 		 195 aa  260  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1259  isopropylmalate isomerase small subunit  64.06 
 
 		 195 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0512287  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1479  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  61.03 
 
 		 195 aa  257  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.113281  normal  0.730621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1150  isopropylmalate isomerase small subunit  67.19 
 
 		 195 aa  257  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000354633 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08750  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  62.37 
 
 		 201 aa  253  9e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00132575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13002  isopropylmalate isomerase small subunit  60.82 
 
 		 198 aa  248  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1597  isopropylmalate isomerase small subunit  61.66 
 
 		 230 aa  235  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.65 
 
 		 195 aa  217  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  48.99 
 
 		 201 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  49.49 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  48.99 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  48.99 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  48.48 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.05 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1533  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.55 
 
 		 202 aa  191  7e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.721417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  48.74 
 
 		 200 aa  191  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  48.74 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  48.74 
 
 		 200 aa  188  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  46.26 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  48.48 
 
 		 201 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  48.48 
 
 		 201 aa  187  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  48.48 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.48 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  48.48 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  48.48 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  48.48 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  48.48 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  48.24 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  47.47 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  47.98 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  46.67 
 
 		 216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  48.98 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  48.24 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  46.45 
 
 		 216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  45.79 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.44 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  44.6 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  44.6 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  45.71 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  45.71 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  45.71 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  45.71 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  45.71 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  45.71 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.1 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  45.71 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  45.24 
 
 		 216 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  45.54 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  47.24 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  45.24 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  45.02 
 
 		 217 aa  178  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  44.29 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.45 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.67 
 
 		 212 aa  177  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.85 
 
 		 197 aa  177  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  44.76 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  47.26 
 
 		 201 aa  176  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.39 
 
 		 201 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  44.29 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  45.23 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  44.08 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  45.23 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  44.08 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  45.73 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>