More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0423 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  52.91 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  51.69 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.36 
 
 		 202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1287  isopropylmalate isomerase small subunit  52.6 
 
 		 193 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.08 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  52.08 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1288  isopropylmalate isomerase small subunit  51.56 
 
 		 193 aa  207  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.83 
 
 		 240 aa  207  9e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  51.04 
 
 		 193 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1314  isopropylmalate isomerase small subunit  51.85 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1494  isopropylmalate isomerase small subunit  51.85 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1423  isopropylmalate isomerase small subunit  51.85 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  50.52 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  52.08 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  50.52 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.45 
 
 		 213 aa  205  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 218 aa  205  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  51.01 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  52.04 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  50.75 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  49.5 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  50.75 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.44 
 
 		 216 aa  201  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.49 
 
 		 212 aa  201  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.33 
 
 		 201 aa  201  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  52.48 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  48.51 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2731  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.76 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.413417  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  50.52 
 
 		 200 aa  198  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.5 
 
 		 215 aa  197  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  49.27 
 
 		 212 aa  197  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  49.27 
 
 		 215 aa  197  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  47.32 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  52.31 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3281  isopropylmalate isomerase small subunit  50.79 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.22 
 
 		 207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  47.4 
 
 		 197 aa  195  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  49.5 
 
 		 216 aa  195  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  50.99 
 
 		 214 aa  195  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  49.27 
 
 		 215 aa  195  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  49.5 
 
 		 216 aa  195  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  49.5 
 
 		 216 aa  195  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  49.01 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  47.52 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.01 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  48.78 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  50.5 
 
 		 214 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  48.02 
 
 		 216 aa  194  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  49.01 
 
 		 214 aa  194  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 		 201 aa  194  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  48.5 
 
 		 212 aa  194  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3568  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.5 
 
 		 203 aa  194  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  48.29 
 
 		 214 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  48.72 
 
 		 201 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  49 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  48.5 
 
 		 212 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1126  isopropylmalate isomerase small subunit  51.7 
 
 		 193 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.76367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  49 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  49.5 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 200 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  47.76 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  46.77 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.01 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  47.94 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.01 
 
 		 215 aa  192  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  48 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  48.08 
 
 		 215 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  48.51 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  46.91 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2134  isopropylmalate isomerase small subunit  52.66 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  48.28 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  47.8 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  47.8 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  48.51 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  47.8 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  47.96 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2097  isopropylmalate isomerase small subunit  52.66 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 214 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  48.47 
 
 		 201 aa  191  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 200 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 215 aa  191  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  46.11 
 
 		 722 aa  192  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  48.28 
 
 		 217 aa  191  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1167  isopropylmalate isomerase small subunit  52.33 
 
 		 196 aa  191  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000149275  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1672  isopropylmalate isomerase small subunit  54.79 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.39 
 
 		 215 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1325  isopropylmalate isomerase small subunit  51.14 
 
 		 193 aa  191  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.5 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.27 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  48.76 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  49.48 
 
 		 200 aa  191  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  49.48 
 
 		 200 aa  191  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  48.44 
 
 		 201 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  48.44 
 
 		 201 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  48.77 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>