More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3462 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 195 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  78.97 
 
 		 195 aa  316  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8017  isopropylmalate isomerase small subunit  79.49 
 
 		 195 aa  312  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1590  isopropylmalate isomerase small subunit  77.32 
 
 		 197 aa  310  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.494308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0627  isopropylmalate isomerase small subunit  73.71 
 
 		 195 aa  299  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  72.16 
 
 		 195 aa  295  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3620  isopropylmalate isomerase small subunit  69.59 
 
 		 195 aa  282  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8048  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  66.15 
 
 		 199 aa  281  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3297  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  66.33 
 
 		 202 aa  280  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2315  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  68.72 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0186  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  68.69 
 
 		 198 aa  279  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1574  isopropylmalate isomerase small subunit  66.67 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2356  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  65.64 
 
 		 213 aa  270  9e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6005  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  64.95 
 
 		 200 aa  269  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0588518  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4052  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  65.82 
 
 		 203 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18550  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  64.29 
 
 		 204 aa  268  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4226  isopropylmalate isomerase small subunit  66.67 
 
 		 197 aa  266  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1922  isopropylmalate isomerase small subunit  66.67 
 
 		 197 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1968  isopropylmalate isomerase small subunit  66.67 
 
 		 197 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1902  isopropylmalate isomerase small subunit  66.15 
 
 		 197 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1259  isopropylmalate isomerase small subunit  66.15 
 
 		 195 aa  265  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0512287  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11110  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  64.1 
 
 		 212 aa  264  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2136  isopropylmalate isomerase small subunit  65.64 
 
 		 197 aa  263  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2255  isopropylmalate isomerase small subunit  62.05 
 
 		 200 aa  263  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09070  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  64.95 
 
 		 197 aa  262  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.656133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1479  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  62.89 
 
 		 195 aa  261  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.113281  normal  0.730621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4998  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  65.64 
 
 		 198 aa  261  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2518  isopropylmalate isomerase small subunit  59.49 
 
 		 200 aa  259  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2847  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  63.59 
 
 		 195 aa  257  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1359  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  61.86 
 
 		 201 aa  257  9e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.778348  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3214  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  63.08 
 
 		 197 aa  254  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0199989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13002  isopropylmalate isomerase small subunit  63.08 
 
 		 198 aa  251  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1150  isopropylmalate isomerase small subunit  65.62 
 
 		 195 aa  251  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000354633 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08750  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  62.05 
 
 		 201 aa  251  6e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00132575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1597  isopropylmalate isomerase small subunit  60.62 
 
 		 230 aa  234  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.87 
 
 		 195 aa  232  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1533  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  60.82 
 
 		 202 aa  229  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.721417  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.9 
 
 		 216 aa  207  8e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.77 
 
 		 197 aa  206  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 216 aa  204  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 216 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  50.23 
 
 		 217 aa  202  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  49.77 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.82 
 
 		 195 aa  203  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  49.54 
 
 		 217 aa  202  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  49.77 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  51.01 
 
 		 201 aa  200  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  51.01 
 
 		 201 aa  200  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  50.95 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  50.75 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  50.95 
 
 		 215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  49.53 
 
 		 216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  49.07 
 
 		 215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  50.95 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.8 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  49.52 
 
 		 216 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  49.07 
 
 		 216 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  49.07 
 
 		 216 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  49.52 
 
 		 216 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  49.07 
 
 		 216 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 		 201 aa  197  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  49.52 
 
 		 214 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  50.24 
 
 		 216 aa  197  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  48.8 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 214 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  51.01 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  51.01 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.01 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  51.01 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  51.01 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  50.23 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  51.9 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  50.72 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  48.56 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  51.01 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  51.01 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 215 aa  195  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  48.84 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 218 aa  195  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  48.33 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  50.25 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  48.33 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  48.57 
 
 		 213 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 200 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  49.25 
 
 		 200 aa  194  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  47.85 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  50.95 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  48.33 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  47.62 
 
 		 212 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>