210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1558 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1558  hypothetical protein  100 
 
 		 782 aa  1608    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2289  secreted effector protein  34.3 
 
 		 782 aa  291  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0339456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2190  secreted effector protein  31.97 
 
 		 782 aa  288  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294947  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2243  secreted effector protein  33.94 
 
 		 782 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.209419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2402  secreted effector protein  33.76 
 
 		 782 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2237  secreted effector protein  32.03 
 
 		 782 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.480484  normal  0.20722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0947  hypothetical protein  24.42 
 
 		 670 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4500  hypothetical protein  23.29 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03910  hypothetical protein  23.06 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3955  conserved hypothetical protein  23.06 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03870  hypothetical protein  23.06 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5519  hypothetical protein  23.04 
 
 		 526 aa  68.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4278  hypothetical protein  22.56 
 
 		 431 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.848192  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2764  hypothetical protein  28.68 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00341411  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1413  hypothetical protein  28.68 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173619  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  31.64 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  34.21 
 
 		 174 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  32.23 
 
 		 165 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  32.82 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  31.01 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.76 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  31.01 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  28.34 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27 
 
 		 862 aa  58.2  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  35.38 
 
 		 449 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31.37 
 
 		 1831 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  35.23 
 
 		 881 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  36.27 
 
 		 408 aa  55.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  25.71 
 
 		 420 aa  55.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  28.92 
 
 		 657 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 348 aa  55.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  33.99 
 
 		 277 aa  55.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 393 aa  55.1  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  31.34 
 
 		 456 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  32.09 
 
 		 204 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  30.37 
 
 		 576 aa  54.3  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  35.51 
 
 		 441 aa  54.3  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  35.43 
 
 		 294 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  40.68 
 
 		 182 aa  54.3  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  32.17 
 
 		 325 aa  54.3  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4526  pentapeptide repeat protein  31.2 
 
 		 362 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.51706 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  32.23 
 
 		 447 aa  53.5  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  29.46 
 
 		 336 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  29.46 
 
 		 336 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2409  pentapeptide repeat-containing protein  34.69 
 
 		 885 aa  53.9  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  26.59 
 
 		 299 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  29.84 
 
 		 412 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  32.2 
 
 		 219 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.72 
 
 		 734 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 278 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  30.47 
 
 		 870 aa  53.5  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 450 aa  53.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  32.39 
 
 		 489 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  25.5 
 
 		 266 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  32.22 
 
 		 844 aa  52.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  28.74 
 
 		 332 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 370 aa  52  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  35.78 
 
 		 190 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.95 
 
 		 309 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 256 aa  51.6  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  25.51 
 
 		 973 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 491 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  26.79 
 
 		 215 aa  51.2  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 		 540 aa  51.2  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  30.84 
 
 		 319 aa  51.2  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  29.12 
 
 		 452 aa  51.2  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 206 aa  51.2  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  29.51 
 
 		 412 aa  50.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  31.45 
 
 		 142 aa  51.2  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  30.57 
 
 		 340 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  32.28 
 
 		 369 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  26.62 
 
 		 225 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  29.94 
 
 		 381 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  29.57 
 
 		 254 aa  50.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  33.07 
 
 		 222 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 		 205 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  33.88 
 
 		 1033 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  32 
 
 		 254 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3106  pentapeptide repeat protein  29.9 
 
 		 978 aa  49.7  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  32 
 
 		 254 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 315 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.55 
 
 		 1901 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4086  pentapeptide repeat-containing protein  30.48 
 
 		 1003 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.791775  normal  0.807746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  26.97 
 
 		 245 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5846  hypothetical protein  30.38 
 
 		 727 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.909355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  22.17 
 
 		 416 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  25.84 
 
 		 903 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  31.53 
 
 		 233 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  29.09 
 
 		 961 aa  49.3  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  35.96 
 
 		 168 aa  49.3  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  35.4 
 
 		 268 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 525 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 		 206 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 567 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  29.33 
 
 		 401 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  33.96 
 
 		 259 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  29.33 
 
 		 401 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  27.97 
 
 		 411 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  38.03 
 
 		 412 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  31.53 
 
 		 233 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>