47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5519 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3955  conserved hypothetical protein  88.66 
 
 		 442 aa  804    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03870  hypothetical protein  88.66 
 
 		 442 aa  804    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5519  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1075    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795524  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03910  hypothetical protein  88.66 
 
 		 442 aa  804    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4500  hypothetical protein  90.62 
 
 		 512 aa  956    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4278  hypothetical protein  88.17 
 
 		 431 aa  771    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.848192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4564  hypothetical protein  83.33 
 
 		 277 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4560  hypothetical protein  87.61 
 
 		 113 aa  202  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3956  hypothetical protein  78.69 
 
 		 64 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2402  secreted effector protein  22.83 
 
 		 782 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2190  secreted effector protein  23.17 
 
 		 782 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294947  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2243  secreted effector protein  22.52 
 
 		 782 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.209419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2289  secreted effector protein  23.17 
 
 		 782 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0339456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2237  secreted effector protein  22.52 
 
 		 782 aa  70.1  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.480484  normal  0.20722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1558  hypothetical protein  23.04 
 
 		 782 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  23.83 
 
 		 456 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  22.35 
 
 		 870 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  23.56 
 
 		 844 aa  53.5  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  22.22 
 
 		 846 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  22.84 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  22.64 
 
 		 949 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  21.28 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  26.14 
 
 		 976 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 348 aa  48.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  21.28 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0449  pentapeptide repeat protein  29.59 
 
 		 198 aa  47.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00280297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0947  hypothetical protein  33.56 
 
 		 670 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  24.66 
 
 		 242 aa  47  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  23.62 
 
 		 343 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  24.19 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1048 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1048 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  23.62 
 
 		 343 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  24.2 
 
 		 242 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  21.95 
 
 		 340 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  24.64 
 
 		 349 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  20.8 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  21.14 
 
 		 880 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  21.14 
 
 		 880 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 		 356 aa  43.9  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  18.95 
 
 		 222 aa  43.5  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  21.57 
 
 		 285 aa  43.5  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  21.14 
 
 		 880 aa  43.5  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  25.55 
 
 		 343 aa  43.5  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  21.14 
 
 		 880 aa  43.5  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  21.14 
 
 		 880 aa  43.5  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>