14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2243 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2243  secreted effector protein  100 
 
 		 782 aa  1628    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.209419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2289  secreted effector protein  98.34 
 
 		 782 aa  1600    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0339456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2237  secreted effector protein  95.4 
 
 		 782 aa  1553    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.480484  normal  0.20722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2190  secreted effector protein  97.06 
 
 		 782 aa  1589    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294947  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2402  secreted effector protein  98.72 
 
 		 782 aa  1611    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1558  hypothetical protein  33.94 
 
 		 782 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0947  hypothetical protein  25.49 
 
 		 670 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4500  hypothetical protein  22.3 
 
 		 512 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5519  hypothetical protein  22.52 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795524  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03910  hypothetical protein  19.91 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3955  conserved hypothetical protein  19.91 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03870  hypothetical protein  19.91 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4278  hypothetical protein  22.51 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.848192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.39 
 
 		 844 aa  50.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>