55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4278 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3955  conserved hypothetical protein  93.74 
 
 		 442 aa  826    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03910  hypothetical protein  93.74 
 
 		 442 aa  826    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5519  hypothetical protein  88.17 
 
 		 526 aa  771    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4500  hypothetical protein  90.26 
 
 		 512 aa  796    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4278  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  887    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.848192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03870  hypothetical protein  93.74 
 
 		 442 aa  826    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4564  hypothetical protein  92.71 
 
 		 277 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4560  hypothetical protein  93.81 
 
 		 113 aa  222  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1558  hypothetical protein  22.56 
 
 		 782 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2402  secreted effector protein  23.4 
 
 		 782 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2243  secreted effector protein  22.51 
 
 		 782 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.209419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2190  secreted effector protein  22.36 
 
 		 782 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294947  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2289  secreted effector protein  23.48 
 
 		 782 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0339456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2237  secreted effector protein  22.51 
 
 		 782 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.480484  normal  0.20722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  25.99 
 
 		 976 aa  53.5  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 355 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  21.34 
 
 		 870 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  22.44 
 
 		 949 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  21.33 
 
 		 844 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  25.18 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  20.86 
 
 		 846 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  20.79 
 
 		 452 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25.27 
 
 		 356 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  20.49 
 
 		 567 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  24.5 
 
 		 200 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 576 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  21.43 
 
 		 485 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  25.14 
 
 		 886 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  21.57 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  25.49 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  21.23 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  22.31 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  22.31 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  21.23 
 
 		 872 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0449  pentapeptide repeat protein  30.23 
 
 		 198 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00280297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  24.66 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  23.44 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  27.85 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 		 215 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0947  hypothetical protein  31.11 
 
 		 670 aa  44.3  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  23.2 
 
 		 327 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  20.55 
 
 		 174 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 197 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  20.83 
 
 		 453 aa  43.5  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 		 193 aa  43.5  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1048 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  21.23 
 
 		 354 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1048 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  19.86 
 
 		 360 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  21.23 
 
 		 354 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  21.23 
 
 		 354 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  21.23 
 
 		 354 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  21.23 
 
 		 354 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>