74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4500 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3955  conserved hypothetical protein  90.93 
 
 		 442 aa  829    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03870  hypothetical protein  90.93 
 
 		 442 aa  829    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03910  hypothetical protein  90.93 
 
 		 442 aa  829    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4500  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1050    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5519  hypothetical protein  90.62 
 
 		 526 aa  956    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4278  hypothetical protein  90.26 
 
 		 431 aa  796    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.848192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4564  hypothetical protein  89.13 
 
 		 277 aa  507  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4560  hypothetical protein  88.5 
 
 		 113 aa  204  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3956  hypothetical protein  89.36 
 
 		 64 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2402  secreted effector protein  22.94 
 
 		 782 aa  77  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2190  secreted effector protein  23.17 
 
 		 782 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294947  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2243  secreted effector protein  22.3 
 
 		 782 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.209419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2289  secreted effector protein  23.34 
 
 		 782 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0339456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2237  secreted effector protein  22.75 
 
 		 782 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.480484  normal  0.20722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1558  hypothetical protein  23.29 
 
 		 782 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  25.5 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  23.03 
 
 		 870 aa  58.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  25.57 
 
 		 976 aa  55.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 		 949 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  20.94 
 
 		 844 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  27.42 
 
 		 355 aa  51.2  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  22.67 
 
 		 485 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  22.67 
 
 		 453 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  22.54 
 
 		 348 aa  50.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  24.82 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  24.82 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  24.82 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  24.82 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  24.82 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  24.82 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  21.03 
 
 		 452 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  20.79 
 
 		 872 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  22.27 
 
 		 354 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 		 356 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 		 359 aa  47.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 		 576 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  22.27 
 
 		 354 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  22.27 
 
 		 354 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  22.27 
 
 		 354 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  22.58 
 
 		 846 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  22.27 
 
 		 354 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  23.03 
 
 		 211 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  23.03 
 
 		 211 aa  47  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  23.03 
 
 		 211 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  25.49 
 
 		 370 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  21.09 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  20.47 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  22.46 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  21.12 
 
 		 1048 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  24.03 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 358 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  21.79 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  22.66 
 
 		 343 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  22.66 
 
 		 343 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  21.12 
 
 		 1048 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  26.15 
 
 		 193 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0947  hypothetical protein  32.88 
 
 		 670 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0449  pentapeptide repeat protein  28.48 
 
 		 198 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00280297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  25.93 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  22.95 
 
 		 215 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  24.12 
 
 		 327 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 		 354 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 		 187 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  24.5 
 
 		 200 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  23.17 
 
 		 349 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  21.8 
 
 		 354 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  24.16 
 
 		 211 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  21.76 
 
 		 340 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  23.42 
 
 		 363 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  21.82 
 
 		 389 aa  43.9  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  23.13 
 
 		 442 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  27.63 
 
 		 180 aa  43.9  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  19.92 
 
 		 866 aa  43.5  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0313  hypothetical protein  29.27 
 
 		 170 aa  43.5  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.967815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>