13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2237 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2243  secreted effector protein  95.4 
 
 		 782 aa  1553    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.209419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2289  secreted effector protein  95.4 
 
 		 782 aa  1550    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0339456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2237  secreted effector protein  100 
 
 		 782 aa  1628    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.480484  normal  0.20722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2190  secreted effector protein  94.63 
 
 		 782 aa  1541    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294947  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2402  secreted effector protein  95.14 
 
 		 782 aa  1546    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1558  hypothetical protein  32.03 
 
 		 782 aa  284  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0947  hypothetical protein  25.82 
 
 		 670 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4500  hypothetical protein  22.75 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5519  hypothetical protein  22.52 
 
 		 526 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795524  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03910  hypothetical protein  20.14 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3955  conserved hypothetical protein  20.14 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03870  hypothetical protein  20.14 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4278  hypothetical protein  22.51 
 
 		 431 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.848192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>