54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3955 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3955  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  909    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03870  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  909    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5519  hypothetical protein  88.66 
 
 		 526 aa  804    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795524  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03910  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  909    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4500  hypothetical protein  90.93 
 
 		 512 aa  829    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4278  hypothetical protein  93.74 
 
 		 431 aa  826    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.848192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4564  hypothetical protein  92.61 
 
 		 277 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4560  hypothetical protein  91.15 
 
 		 113 aa  211  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1558  hypothetical protein  23.06 
 
 		 782 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2402  secreted effector protein  21.97 
 
 		 782 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2190  secreted effector protein  20.51 
 
 		 782 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294947  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2243  secreted effector protein  19.91 
 
 		 782 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.209419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2289  secreted effector protein  21.2 
 
 		 782 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0339456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2237  secreted effector protein  20.14 
 
 		 782 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.480484  normal  0.20722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  24.1 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  26.62 
 
 		 976 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  22.15 
 
 		 870 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  23.95 
 
 		 576 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  23.26 
 
 		 348 aa  49.7  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0449  pentapeptide repeat protein  31.01 
 
 		 198 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00280297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  21.39 
 
 		 846 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.6 
 
 		 949 aa  47.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  25.18 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  22.99 
 
 		 872 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  22.6 
 
 		 359 aa  47  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  27.35 
 
 		 355 aa  47  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  20.73 
 
 		 844 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  25.68 
 
 		 211 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  21.92 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  25.68 
 
 		 211 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  23.26 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  21.43 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  20.67 
 
 		 567 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  28.72 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  20.83 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  24.81 
 
 		 886 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  25.68 
 
 		 211 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 197 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  21.69 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1048 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  24.5 
 
 		 200 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1048 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  21.69 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  21.23 
 
 		 174 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  22.31 
 
 		 343 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  21.43 
 
 		 485 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  22.31 
 
 		 343 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  20.49 
 
 		 243 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  21.69 
 
 		 360 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  22.3 
 
 		 245 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0947  hypothetical protein  25.6 
 
 		 670 aa  43.1  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  24.84 
 
 		 370 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  20.86 
 
 		 363 aa  43.1  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  21.9 
 
 		 521 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>