110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3168 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  100 
 
 		 600 aa  1237    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  46.37 
 
 		 672 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  42.46 
 
 		 624 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  41.06 
 
 		 606 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  33.06 
 
 		 618 aa  302  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  31.14 
 
 		 466 aa  163  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  26.02 
 
 		 625 aa  163  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  27.23 
 
 		 435 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  27.29 
 
 		 431 aa  136  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  29.49 
 
 		 432 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  27.53 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  27.03 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  28.73 
 
 		 445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.77 
 
 		 472 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  26.26 
 
 		 457 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 457 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  29.26 
 
 		 465 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  24.89 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 475 aa  111  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.23 
 
 		 459 aa  110  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  28.54 
 
 		 457 aa  107  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  28.82 
 
 		 478 aa  103  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 421 aa  102  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 453 aa  101  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.92 
 
 		 461 aa  99.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 443 aa  99  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  26.69 
 
 		 456 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  34.12 
 
 		 491 aa  96.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 462 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  27.03 
 
 		 445 aa  94.4  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  26.33 
 
 		 444 aa  87  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.5 
 
 		 722 aa  85.1  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2103  hypothetical protein  26.9 
 
 		 583 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.469533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.35 
 
 		 641 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  36.5 
 
 		 748 aa  77.4  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 460 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  26.27 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  27.53 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  23.85 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  26.11 
 
 		 582 aa  74.3  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 414 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  33.79 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  26.5 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.18 
 
 		 600 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  25.27 
 
 		 595 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  30.87 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  29.79 
 
 		 758 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.06 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  29.83 
 
 		 621 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  20.94 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  20.47 
 
 		 534 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  31.3 
 
 		 764 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  30.26 
 
 		 531 aa  63.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  25.57 
 
 		 584 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  22.24 
 
 		 764 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  25.62 
 
 		 584 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  29.41 
 
 		 595 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  24.3 
 
 		 599 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  23.3 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  32.43 
 
 		 619 aa  60.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  30.71 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  27.78 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  21.23 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  32.08 
 
 		 797 aa  58.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  29.89 
 
 		 680 aa  57  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 538 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  31.69 
 
 		 543 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  26.83 
 
 		 763 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  26.67 
 
 		 530 aa  53.9  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  30.07 
 
 		 532 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  31.29 
 
 		 595 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  34.88 
 
 		 549 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  32.26 
 
 		 761 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  26.58 
 
 		 706 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 537 aa  50.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  23.22 
 
 		 784 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  29.2 
 
 		 660 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  30.08 
 
 		 547 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  26.53 
 
 		 669 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  28.32 
 
 		 668 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 676 aa  47.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  27.52 
 
 		 549 aa  47.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  21.41 
 
 		 595 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  23.23 
 
 		 568 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3104  hypothetical protein  21.35 
 
 		 558 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>