26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2103 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2103  hypothetical protein  100 
 
 
583 aa  1182    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.469533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2315  hypothetical protein  39.69 
 
 
566 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.326994  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3104  hypothetical protein  36.4 
 
 
558 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  27.64 
 
 
624 aa  110  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  30.04 
 
 
606 aa  106  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  24.42 
 
 
600 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  25.32 
 
 
672 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  23.26 
 
 
457 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
464 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  23.08 
 
 
618 aa  60.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 
453 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  25.48 
 
 
466 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.57 
 
 
722 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  23.35 
 
 
680 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  23.62 
 
 
459 aa  51.2  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  27.5 
 
 
459 aa  50.8  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
537 aa  50.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  24.77 
 
 
445 aa  49.3  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
538 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
455 aa  47  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
475 aa  47  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  25.97 
 
 
456 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  23.37 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  28.48 
 
 
527 aa  45.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  28.99 
 
 
549 aa  44.3  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32 
 
 
641 aa  44.3  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>