21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3104 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3104  hypothetical protein  100 
 
 
558 aa  1147    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2315  hypothetical protein  44.75 
 
 
566 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.326994  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2103  hypothetical protein  36.4 
 
 
583 aa  256  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.469533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  26.25 
 
 
624 aa  82.8  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  23.23 
 
 
618 aa  73.9  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  23.32 
 
 
672 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  24.77 
 
 
606 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  21.23 
 
 
600 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  26.5 
 
 
758 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  26.37 
 
 
797 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  31.34 
 
 
459 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  22.67 
 
 
761 aa  50.4  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  26.94 
 
 
757 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
453 aa  47  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  26.47 
 
 
431 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  27.84 
 
 
764 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  25 
 
 
549 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  35 
 
 
454 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  34.34 
 
 
584 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  29.89 
 
 
435 aa  43.5  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  34.34 
 
 
584 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>