126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2836 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.3 
 
 		 722 aa  670    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  56.82 
 
 		 758 aa  876    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  100 
 
 		 797 aa  1613    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  57.5 
 
 		 764 aa  869    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  54.64 
 
 		 757 aa  837    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  51.91 
 
 		 764 aa  803    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  42.03 
 
 		 761 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  37.22 
 
 		 748 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  36.24 
 
 		 784 aa  325  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  43.14 
 
 		 641 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.38 
 
 		 600 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  34.16 
 
 		 763 aa  177  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  27.23 
 
 		 466 aa  120  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  26.9 
 
 		 457 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  27.95 
 
 		 435 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  24.32 
 
 		 431 aa  103  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 464 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 423 aa  100  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 421 aa  96.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  26.85 
 
 		 454 aa  92  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  34.73 
 
 		 432 aa  91.7  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 414 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  26.86 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  36.96 
 
 		 672 aa  84.3  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  37.32 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  22.46 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  23.39 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.53 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  36.03 
 
 		 606 aa  74.3  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  25.54 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  36.17 
 
 		 582 aa  73.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  30 
 
 		 624 aa  72.4  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  30.77 
 
 		 600 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.89 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  24.94 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  32.74 
 
 		 599 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  37.9 
 
 		 531 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  40.82 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  40.82 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  36.52 
 
 		 440 aa  66.6  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 433 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  24.57 
 
 		 619 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  32.31 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  27.1 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 537 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  31.03 
 
 		 595 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  25.64 
 
 		 621 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  33.33 
 
 		 691 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  27.75 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  26.47 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 676 aa  60.1  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 538 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  31.76 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  27.67 
 
 		 584 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  27.61 
 
 		 584 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  34.35 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  31.3 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  27.78 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  34.35 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  36.36 
 
 		 595 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  30.41 
 
 		 547 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  30.4 
 
 		 530 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  31.58 
 
 		 456 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  31.58 
 
 		 465 aa  55.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  30.57 
 
 		 601 aa  55.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  31.82 
 
 		 679 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  28.17 
 
 		 543 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  30.86 
 
 		 457 aa  55.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  28.79 
 
 		 514 aa  55.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  31.82 
 
 		 679 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 402 aa  55.1  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  29.55 
 
 		 669 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  35.78 
 
 		 675 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  32.31 
 
 		 660 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 468 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  27.71 
 
 		 668 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.82 
 
 		 540 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  33.33 
 
 		 437 aa  52.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  25.81 
 
 		 595 aa  52  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  28.99 
 
 		 596 aa  51.2  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  27.22 
 
 		 618 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.57 
 
 		 534 aa  50.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  27.74 
 
 		 595 aa  49.7  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  31.58 
 
 		 531 aa  50.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  29.77 
 
 		 549 aa  49.3  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 460 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  33.59 
 
 		 692 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36 
 
 		 519 aa  48.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.98 
 
 		 461 aa  48.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  31.18 
 
 		 527 aa  47.8  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>