64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5943 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  66.54 
 
 		 595 aa  739    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  100 
 
 		 543 aa  1143    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  65.93 
 
 		 547 aa  739    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  64.83 
 
 		 550 aa  748    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  51.05 
 
 		 706 aa  488  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  46.27 
 
 		 680 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  45.47 
 
 		 668 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  41.88 
 
 		 531 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  36.5 
 
 		 549 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1261  xanthan lyase protein  36.01 
 
 		 592 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.21 
 
 		 582 aa  93.2  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  22.47 
 
 		 599 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  23.36 
 
 		 619 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  22.22 
 
 		 584 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  23.59 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  22.04 
 
 		 584 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  22.88 
 
 		 595 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  24.52 
 
 		 621 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  22.16 
 
 		 534 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  22.16 
 
 		 585 aa  67  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  24.14 
 
 		 595 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  23.88 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  23.97 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  32.21 
 
 		 672 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  29.58 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 538 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  33.56 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  27.17 
 
 		 606 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.31 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  24.6 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  26.32 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  23.09 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  26.76 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  20.3 
 
 		 595 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  31.69 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  22.62 
 
 		 595 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  28.99 
 
 		 466 aa  55.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  23.44 
 
 		 532 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  28.57 
 
 		 432 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 537 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  27.54 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 		 464 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  29.08 
 
 		 491 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  27.13 
 
 		 435 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  24.88 
 
 		 549 aa  50.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  24 
 
 		 454 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  27.1 
 
 		 601 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.66 
 
 		 600 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 483 aa  47.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.07 
 
 		 472 aa  47  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  25.56 
 
 		 764 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  26.39 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  25.52 
 
 		 758 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  29.29 
 
 		 797 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  28.21 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  28.86 
 
 		 784 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.34 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  41.07 
 
 		 641 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>