95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2340 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  100 
 
 		 763 aa  1577    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.76 
 
 		 600 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  35.84 
 
 		 757 aa  221  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  35.14 
 
 		 764 aa  217  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  35.48 
 
 		 758 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  33.41 
 
 		 764 aa  209  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  35.63 
 
 		 748 aa  190  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  34.16 
 
 		 797 aa  189  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  34.12 
 
 		 761 aa  184  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.54 
 
 		 722 aa  178  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.64 
 
 		 641 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  33.67 
 
 		 784 aa  158  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  28.44 
 
 		 435 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  26.87 
 
 		 448 aa  103  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  26.23 
 
 		 431 aa  100  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 423 aa  98.6  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.96 
 
 		 472 aa  92  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  26.92 
 
 		 706 aa  89.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  23.95 
 
 		 466 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  24.13 
 
 		 445 aa  84  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  25.16 
 
 		 457 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 443 aa  72  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.28 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  26.17 
 
 		 582 aa  68.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.15 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  33.6 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  28.4 
 
 		 599 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  23.7 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  23.06 
 
 		 606 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  23.38 
 
 		 600 aa  63.9  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  28.35 
 
 		 432 aa  63.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 441 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 457 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  28.66 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  30.16 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  29.29 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  26.09 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  26.09 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  27.74 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 		 457 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  31.48 
 
 		 478 aa  60.1  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  23.91 
 
 		 668 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  30 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  23.13 
 
 		 483 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  32.72 
 
 		 531 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 		 414 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 454 aa  56.6  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 433 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 455 aa  56.6  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  28.67 
 
 		 621 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  23.19 
 
 		 595 aa  53.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 421 aa  53.5  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  26.67 
 
 		 672 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  27.97 
 
 		 619 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  30.97 
 
 		 444 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  21.38 
 
 		 680 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  31.36 
 
 		 437 aa  50.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3592  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1136 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0789329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  24.11 
 
 		 624 aa  50.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  27.49 
 
 		 514 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  27.45 
 
 		 527 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  22.25 
 
 		 595 aa  48.5  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 460 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  30.3 
 
 		 391 aa  48.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 457 aa  47.8  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  25.16 
 
 		 530 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 		 546 aa  47.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  22.09 
 
 		 456 aa  47  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5047  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  59.38 
 
 		 629 aa  47.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.018834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  27.78 
 
 		 465 aa  47  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1978  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  63.33 
 
 		 633 aa  45.8  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.98 
 
 		 519 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1692  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  57.89 
 
 		 464 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215126 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 402 aa  45.8  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4012  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  62.07 
 
 		 630 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.775165  normal  0.335269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3591  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  57.89 
 
 		 464 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.343336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2151  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  57.89 
 
 		 464 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148708  decreased coverage  0.00883462 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0856  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  58.82 
 
 		 629 aa  45.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0015  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  61.29 
 
 		 639 aa  44.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.408302  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0012  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  61.29 
 
 		 640 aa  44.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00804993  hitchhiker  0.00441278 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1128  glucose inhibited division protein A  63.33 
 
 		 619 aa  44.7  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0710  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  62.07 
 
 		 640 aa  44.7  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0073  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  62.07 
 
 		 673 aa  44.3  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.447935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1603  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  55.26 
 
 		 464 aa  44.3  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.073582  normal  0.0278892 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2039  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  56.25 
 
 		 625 aa  44.3  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1598  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  62.07 
 
 		 620 aa  43.9  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000983161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>