226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0942 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  934    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  39.46 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  37.91 
 
 
448 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 
464 aa  236  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  34.96 
 
 
435 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  33.8 
 
 
445 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
457 aa  219  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 
475 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 
423 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.67 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  31.22 
 
 
431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  31.63 
 
 
478 aa  186  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  30.04 
 
 
454 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  31.48 
 
 
432 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
443 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  32.71 
 
 
465 aa  170  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.06 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  28.34 
 
 
491 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 
454 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  29.58 
 
 
456 aa  156  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.31 
 
 
600 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
421 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
468 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  28.25 
 
 
624 aa  150  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.02 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
441 aa  146  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 
455 aa  143  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  29.16 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  27.98 
 
 
444 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  27.05 
 
 
618 aa  140  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  31.34 
 
 
457 aa  139  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
451 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  27.87 
 
 
606 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 
414 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  27.08 
 
 
672 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  28.29 
 
 
459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
460 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  29.04 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
457 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  27.29 
 
 
764 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  25.4 
 
 
440 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
445 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  28.04 
 
 
797 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  28.35 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  26.93 
 
 
764 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 
483 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.53 
 
 
600 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  25.65 
 
 
758 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  26.18 
 
 
437 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
460 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.2 
 
 
641 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  25.16 
 
 
763 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
411 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  24.89 
 
 
761 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  26.79 
 
 
531 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  35.03 
 
 
757 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  22.78 
 
 
527 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  22.93 
 
 
595 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.57 
 
 
722 aa  70.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  22.01 
 
 
680 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  29.95 
 
 
514 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.9 
 
 
582 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
441 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  33.09 
 
 
748 aa  65.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  23.28 
 
 
784 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  23.27 
 
 
584 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  25.83 
 
 
599 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  28.47 
 
 
584 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  23.41 
 
 
625 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  21.34 
 
 
532 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  27.54 
 
 
549 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  21.6 
 
 
595 aa  57  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  22.09 
 
 
531 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
537 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.35 
 
 
540 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  28.78 
 
 
595 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  28.95 
 
 
547 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2103  hypothetical protein  22.99 
 
 
583 aa  53.5  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.469533  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  57.5 
 
 
245 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.97 
 
 
457 aa  52.8  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  21.49 
 
 
530 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.83 
 
 
396 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  23.72 
 
 
595 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  24.67 
 
 
595 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.11 
 
 
395 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  27.54 
 
 
543 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  63.41 
 
 
427 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 
458 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  28.91 
 
 
549 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  26.67 
 
 
621 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 
538 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  56.1 
 
 
484 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  60.98 
 
 
436 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.372109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>