137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5893 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  100 
 
 		 444 aa  897    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  52.4 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  53.23 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  38.11 
 
 		 459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  40.44 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  38.03 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  36.92 
 
 		 445 aa  226  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  34.78 
 
 		 445 aa  226  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 446 aa  222  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.37 
 
 		 472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  37.02 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 		 464 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  35.62 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  34.73 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 		 421 aa  192  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  36.31 
 
 		 478 aa  177  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  29.06 
 
 		 431 aa  176  9e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  30.63 
 
 		 432 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  31.61 
 
 		 456 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  34.04 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.48 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 441 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  28.34 
 
 		 457 aa  156  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  32.63 
 
 		 457 aa  156  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  30.8 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  30.77 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  32.3 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  25.93 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  26.11 
 
 		 600 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  29.28 
 
 		 606 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.82 
 
 		 641 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  24.5 
 
 		 618 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  31.49 
 
 		 624 aa  109  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  33.02 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  27.33 
 
 		 757 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  26.37 
 
 		 672 aa  96.7  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.85 
 
 		 722 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  26.62 
 
 		 764 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 460 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  27.32 
 
 		 797 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  25.97 
 
 		 764 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  36.26 
 
 		 748 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  22.6 
 
 		 625 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.78 
 
 		 600 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  27.8 
 
 		 784 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  25.16 
 
 		 582 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  31.49 
 
 		 680 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  41.51 
 
 		 761 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  22.81 
 
 		 763 aa  60.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  30.46 
 
 		 758 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  30.28 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  33.57 
 
 		 549 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  24.58 
 
 		 514 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  25.14 
 
 		 668 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 534 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  26.62 
 
 		 595 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  41.67 
 
 		 675 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  27.78 
 
 		 584 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  30.41 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  27.78 
 
 		 584 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  50 
 
 		 509 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.97 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1261  xanthan lyase protein  25.59 
 
 		 592 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 676 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  24.34 
 
 		 550 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  24.24 
 
 		 595 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  24.38 
 
 		 595 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  41.38 
 
 		 669 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  26.17 
 
 		 595 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  42.86 
 
 		 696 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  42.86 
 
 		 696 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.22 
 
 		 415 aa  47.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.372109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.29 
 
 		 509 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 537 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  43.33 
 
 		 1000 aa  46.6  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1531  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.84 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  45.16 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 538 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.37 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1577  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  29.94 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00876863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  29.24 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  23.2 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002019  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  41.67 
 
 		 631 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.01188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>