91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3278 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  92.31 
 
 
446 aa  753    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
445 aa  897    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  73.3 
 
 
441 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  69.51 
 
 
440 aa  565  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  53.9 
 
 
451 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  55.47 
 
 
457 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  37.13 
 
 
459 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 
453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  39.03 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 
464 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.44 
 
 
472 aa  225  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  37.9 
 
 
444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  33.04 
 
 
466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 
454 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  37.44 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  37.14 
 
 
478 aa  197  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
423 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  32.51 
 
 
435 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  29.76 
 
 
448 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
457 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 
457 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 
475 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  29.15 
 
 
445 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  29.17 
 
 
454 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  29.13 
 
 
432 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
468 aa  143  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  26.85 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
462 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
441 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.88 
 
 
461 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  31.41 
 
 
457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
460 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
421 aa  126  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
414 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  27.61 
 
 
456 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  28.25 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  27.54 
 
 
491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  27.87 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  23.43 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  24.34 
 
 
459 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  28.77 
 
 
624 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  27.21 
 
 
483 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  28.13 
 
 
797 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  25.3 
 
 
757 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
483 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  23.73 
 
 
764 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  25.29 
 
 
600 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  24.38 
 
 
764 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  28.3 
 
 
606 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 
460 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  25.54 
 
 
672 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  30.69 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  31.82 
 
 
763 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  33.08 
 
 
758 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  24.26 
 
 
748 aa  67.8  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  23.15 
 
 
641 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  24.83 
 
 
761 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  31.55 
 
 
680 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.34 
 
 
600 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  20.42 
 
 
618 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.22 
 
 
407 aa  54.3  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  26.29 
 
 
784 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  44.71 
 
 
536 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.1 
 
 
582 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.54 
 
 
722 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  48.28 
 
 
542 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  23 
 
 
619 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  28.89 
 
 
549 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 
476 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3480  hypothetical protein  60 
 
 
623 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  26.52 
 
 
531 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.91 
 
 
619 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 
459 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  42.31 
 
 
535 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  22.16 
 
 
599 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  32.35 
 
 
458 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.72 
 
 
534 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  27.42 
 
 
595 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0582  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.51 
 
 
503 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  41.38 
 
 
549 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  24.66 
 
 
595 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  47.73 
 
 
561 aa  43.5  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  25 
 
 
595 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  50 
 
 
525 aa  43.5  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.78 
 
 
435 aa  43.5  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  28.8 
 
 
431 aa  43.5  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  35 
 
 
512 aa  43.1  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.85 
 
 
519 aa  43.1  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>