92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0966 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1100    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  41.88 
 
 		 543 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  42.35 
 
 		 550 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  39.46 
 
 		 680 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  42.01 
 
 		 595 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  41.79 
 
 		 547 aa  361  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  40.34 
 
 		 549 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  39.89 
 
 		 706 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  37.48 
 
 		 668 aa  343  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1261  xanthan lyase protein  29.91 
 
 		 592 aa  202  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  27.05 
 
 		 466 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.36 
 
 		 472 aa  104  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  25.83 
 
 		 582 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  23.67 
 
 		 514 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  26.75 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  25.93 
 
 		 748 aa  89.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 534 aa  87.4  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.41 
 
 		 459 aa  86.7  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  23.85 
 
 		 595 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  24.9 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  34.88 
 
 		 672 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  23.83 
 
 		 584 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  23.83 
 
 		 584 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  33.33 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  23.99 
 
 		 599 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  30.11 
 
 		 606 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  37.68 
 
 		 764 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  22.56 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  25.93 
 
 		 761 aa  73.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  24.19 
 
 		 549 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  33.79 
 
 		 600 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  22.55 
 
 		 585 aa  72  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.29 
 
 		 722 aa  71.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  35.62 
 
 		 758 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  24.21 
 
 		 619 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  24.51 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  25 
 
 		 595 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  30.72 
 
 		 624 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.57 
 
 		 641 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  36.52 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  23.3 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  21.73 
 
 		 595 aa  63.9  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.35 
 
 		 600 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  24.75 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  26.79 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  30.27 
 
 		 618 aa  60.5  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  23.42 
 
 		 595 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  28.16 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.09 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  23.84 
 
 		 621 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  28.67 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  35.24 
 
 		 757 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  22.07 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  32.72 
 
 		 763 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  24.31 
 
 		 530 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  23.15 
 
 		 601 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  35.14 
 
 		 448 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  32.82 
 
 		 457 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  31.36 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  35.43 
 
 		 764 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.25 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  28.26 
 
 		 459 aa  51.6  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  22.46 
 
 		 531 aa  51.2  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  22.2 
 
 		 532 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 457 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  25.33 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  29.06 
 
 		 784 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  29.14 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10660  thioredoxin reductase  38.27 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  31.82 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0828  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  27.04 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0259536  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4454  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.49 
 
 		 577 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  48 
 
 		 465 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  26.9 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 457 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1577  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  50 
 
 		 463 aa  44.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00876863  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  48 
 
 		 465 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 676 aa  43.9  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  54.76 
 
 		 472 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>