25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1261 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1261  xanthan lyase protein  100 
 
 		 592 aa  1218    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  36.2 
 
 		 680 aa  302  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  36.01 
 
 		 550 aa  297  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  36.01 
 
 		 543 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  34.32 
 
 		 595 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  36.41 
 
 		 706 aa  259  7e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  34.59 
 
 		 668 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  34.02 
 
 		 547 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  31.42 
 
 		 531 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  32.18 
 
 		 549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  26.11 
 
 		 595 aa  52.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  25.31 
 
 		 466 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  38.89 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  26.26 
 
 		 599 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 		 464 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  25.3 
 
 		 582 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 423 aa  47.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  28.57 
 
 		 435 aa  47.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  24.04 
 
 		 584 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  24.52 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 475 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  25.71 
 
 		 595 aa  45.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  29.34 
 
 		 600 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  24.53 
 
 		 584 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  26.29 
 
 		 448 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>