64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2074 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  100 
 
 		 706 aa  1469    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  50 
 
 		 595 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  51.05 
 
 		 543 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  43 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  51.34 
 
 		 547 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  43.36 
 
 		 668 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  49.52 
 
 		 550 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  39.89 
 
 		 531 aa  364  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  40.31 
 
 		 549 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1261  xanthan lyase protein  36.06 
 
 		 592 aa  257  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  39.71 
 
 		 984 aa  98.6  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  26.92 
 
 		 763 aa  90.5  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  23.24 
 
 		 514 aa  89  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  39.26 
 
 		 717 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.86 
 
 		 582 aa  82  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  23.27 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  24.7 
 
 		 619 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  28.65 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.03 
 
 		 600 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  20.91 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  28.93 
 
 		 599 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  29.95 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  29.1 
 
 		 585 aa  61.6  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  22.62 
 
 		 621 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  28.47 
 
 		 491 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 464 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  27.59 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  29.38 
 
 		 584 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.43 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  28.87 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  29.38 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.29 
 
 		 540 aa  57  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  30.59 
 
 		 624 aa  56.6  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  28.64 
 
 		 618 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  28.05 
 
 		 606 aa  56.6  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  26.42 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 453 aa  54.3  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  24.56 
 
 		 527 aa  53.9  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 538 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  33.08 
 
 		 532 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6415  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.69 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  30.14 
 
 		 672 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  30.41 
 
 		 530 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  28.57 
 
 		 532 aa  52.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  34.01 
 
 		 445 aa  52.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  26.21 
 
 		 432 aa  52  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.37 
 
 		 461 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.48 
 
 		 459 aa  49.3  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  29.29 
 
 		 595 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  26.32 
 
 		 531 aa  48.5  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.34 
 
 		 600 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  34.85 
 
 		 676 aa  47.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  25.29 
 
 		 764 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  26.29 
 
 		 758 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  26.8 
 
 		 784 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  24.21 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  24.32 
 
 		 457 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.68 
 
 		 722 aa  45.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 537 aa  45.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  24.32 
 
 		 483 aa  44.3  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  27.12 
 
 		 748 aa  43.9  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>